MaDICS

Offre de stage Master 2 : Constitution et analyse d’un corpus multimodal (parole–oculométrie) d’entretiens de bilan psychiatrique à des fins d’aide à l’évaluation médicale

Mar 15 – Mar 16 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : IMT Atlantique / CHU Brest
Durée : 5 mois
Contact : yannis.haralambous@telecom-bretagne.eu
Date limite de publication : 2025-03-15

Contexte :
Lors des entretiens de bilan psychiatrique, les psychiatres s’appuient sur des signaux faibles afin d’élaborer un diagnostic et une prise en charge adaptée. Dans ce contexte, les outils d’aide à la décision peuvent apporter une aide décisive pour orienter le clinicien et améliorer la prise en charge.

On s’intéressera particulièrement dans le cadre de ce stage aux signaux liés aux discours et au regard de personnes à risque de souffrir de santé mentale. Le stage est ainsi interdisciplinaire, entre psychiatrie, traitement automatique de la langue et oculométrie. Son objectif est la mise en place d’une procédure d’acquisition et de traitement de corpus multimodal parole/oculométrie pour les entretiens de bilan psychiatrique. Le but est d’agréger les deux modalités pour obtenir des meilleures performances en matière de détection de comorbidités et avec l’espoir de pouvoir extraire, ultérieurement, de ces données des indicateurs de diagnostic précoce de pathologie(s).

Sujet :
Le stage procédera par les étapes suivantes.

1) La mise en place d’outils d’acquisition de corpus multimodal (enregistrement de la parole, transcription, mouvements oculaires).

2) L’enregistrement du corpus d’une dizaine d’entretiens de bilan psychiatriques (exécuté par le CHU).

3) La prise en main et l’application d’algorithmes déjà existants d’alignement de la transcription écrite et de la parole.

4) L’ajout de données oculométriques, tant au niveau des saccades oculaires qu’au niveau de la cible du regard.

5) Expérimentations et analyse sur le corpus en utilisant l’équipement mis en place, afin de repérer des réactions du patient, aux niveaux linguistique et oculométrique.

Les livrables attendus sont :

(a) Déploiement et adaptation de dispositifs et de logiciels (les chaînes d’acquisition et de traitement de données multimodales).

(b) Le corpus multimodal acquis, sous forme de ressource réutilisable.

(d) Rapport de stage.

Profil du candidat :
Étudiant en M2 en traitement automatique de la langue ou en IA ou en sciences cognitives ou élève-ingénieur.

• Intérêt pour la recherche dans le domaine de la santé ;
• bonne expérience en programmation Python, en particulier en traitement des données ;
• aptitude à comprendre et à déployer des outils existants, à expérimenter en autonomie ;
• des connaissances ou une expérience préalable en traitement automatique de la langue et/ou en analyse de corpus seraient un avantage majeur.

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
ENCADRANTS
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Gábor Bella, IMT Atlantique
Yannis Haralambous, IMT Atlantique
Philippe Lenca, IMT Atlantique
Sorin Moga, IMT Atlantique
Laurent Navarro, École des Mines de Saint-Étienne
Christophe Lemey, CHU de Brest

CONTACTS
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Envoyer votre CV, lettre de motivation, relevés de notes et tout autre document à

Yannis Haralambous, IMT Atlantique : yannis.haralambous@imt-atlantique.fr
Gábor Bella, IMT Atlantique : gabor.bella@imt-atlantique.fr

Categories: Stages

Représentation des grandeurs physiques dans le Web sémantique

Mar 15 – Mar 16 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Mines Saint-Étienne
Durée : 4-6 mois
Contact : antoine.zimmermann@emse.fr
Date limite de publication : 2025-03-15

Contexte :
Les grandeurs physiques constituent une part importante de ce qui est représenté dans les données scientifiques, les données médicales, les données industrielles, les données ouvertes et, dans une certaine mesure, diverses données privées.

Qu’il s’agisse de distances, de vitesses, de charges utiles dans les transports, de concentrations, de masses, de moles en chimie, de puissances, d’intensités, de tensions dans le secteur de l’énergie, de dimensions de meubles, de poids, de tailles de personnes, de durées, et bien d’autres encore dans le domaine de la santé, il est nécessaire de représenter les grandeurs physiques, de les stocker, de les traiter et de les échanger entre systèmes d’information, potentiellement à l’échelle mondiale, souvent sur l’internet et via le Web.

Sujet :
Dans ce stage, nous cherchons à définir précisément une manière de représenter sans ambiguïté les grandeurs physiques pour le Web des données. Plus précisément, nous étudierons les propositions faites pour encoder les grandeurs physiques dans le modèle de données standard du Web sémantique, RDF. Nous nous intéresserons particulièrement à l’utilisation d’un type de données dédié à cet encodage, probablement adapté de la proposition de Lefrançois & Zimmermann (2018) basée sur le standard UCUM.

Après avoir établi une définition rigoureuse du type de données (éventuellement de ses variantes, si pertinent), nous nous concentrerons sur l’implémentation d’un module capable de lire/écrire et de traiter les grandeurs physiques et leurs opérations au sein des API de manipulation de données RDF, pour la gestion, l’interrogation et le raisonnement sur des graphes de connaissances contenant des grandeurs physiques.

L’ambition est que, d’une part, la spécification devienne dans quelques années un standard de facto, avant peut-être de devenir un standard de jure ; et que, d’autre part, l’implémentation soit la référence permettant de comparer les niveaux de conformité d’autres implémentations futures.

Cette étude devrait conduire à la publication d’un article scientifique dans une revue scientifique à fort impact.

Détails du sujet et de comment candidater sur https://www.emse.fr/~zimmermann/Teaching/SemWeb/Internship/

Profil du candidat :
Master 2 en informatique voulant avoir une expérience en recherche, éventuellement dans le but de poursuivre des études doctorales.

Formation et compétences requises :
Compétences requises en Web sémantique (RDF, SPARQL, etc.).

Adresse d’emploi :
158 cours Fauriel
CS 62362
42023 Saint-Étienne Cedex 2
France

Categories: Stages

Mar

Mon

Action Recognition by Knowledge Augmentation in Vision Language Model

Mar 31 – Apr 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : TIDS/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire ICube, Strasbourg
Durée : 6 mois
Contact : seo@unistra.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Action recognition from video is highly important for assistive care robots, as it enables them to understand and respond appropriately to the needs and activities of the people they assist. Recent DL models for action recognition are moving toward more data-efficient, interpretable, and computationally optimized frameworks: The combination of transformer architectures, spatio-temporal attention, multimodal fusion, and self-supervised learning, just to mention a few. Meanwhile, the recent emergence of large-scale pre-trained vision-language models (VLMs) has demonstrated remarkable performance and transferability to different types of visual recognition tasks, thanks to their generalizable visual and textual representations. It has been confirmed by our recent study, where our developed model learns and improves visual, textual, and numerical representations of patient gait videos based on a large-scale pre-trained Vision Language Model (VLM), for several classification tasks.

Sujet :
Motivated by these recent successes, we will extend our previous developed model and the multimodal representation for a new classification task – action recognition from video. Similarly to our previous method, we will adopt the prompt learning strategy, keeping the pre-trained VLM frozen to preserve its general representation and leverage the pre-aligned multi-modal latent space the prompt’s context with learnable vectors, which is initialized with domain-specific knowledge.

Profil du candidat :
− Solid programming skills in Python/C++
− Experience in Deep Learning (Transformer, CLIP, etc.)
− Good communication skills

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
2 Rue Marie Hamm
67000 Strasbourg

Document attaché : 202411071346_Stage-ActionRecognition.pdf

Categories: Stages

Analyse numérique de l’engagement d’apprenants dans des situations d’apprentissage en ligne

Mar 31 – Apr 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : CReSTIC – Université de Reims Champagne-Ardenne
Durée : 4 à 6 mois
Contact : bart.lamiroy@loria.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Ce travail se place dans un projet de recherche en collaboration avec Santé Publique France.
Ce stage de Master se situe en amont et en parallèle des recherches menés dans le cadre de ce projet et consiste à choisir et mettre en place les outils adéquats en analyse statistique de données et d’extraction de connaissances à partir de traces d’interaction avec un site d’apprentissage en ligne afin de mesurer l’impact de l’outil de formation et de mesurer l’engagement des apprenants dans leur démarche.

Sujet :
Le but est d’établir des profils d’usagers à partir des interactions de ceux-ci avec une plateforme d’apprentissage en ligne, afin d’évaluer l’adéquation de l’outil numérique proposé, et de faire des préconisations pour son évolution à partir de données anonymisées.

• Il s’agira de concevoir et appliquer des outils d’analyse statistique des données et d’extraction de connaissances à partir des données de cette expérimentation.
• Des algorithmes d’analyse de données et de classification seront utiles pour mettre en exergue des corrélations, interdépendances ou autres similarités dans les parcours d’apprentissage.

Profil du candidat :

Formation et compétences requises :
La candidate ou le candidat a in niveau de formation M2 et une bonne connaissance en analyse de données numérique et de programmation. Elle ou il maîtrise Python ou R.
La curiosité, l’autonomie et le sens de travail en équipe seront également des facteurs déterminants.

Adresse d’emploi :
CReSTIC
UFR Sciences Exactes et Naturelles
Moulin de la Housse – BP 1039
51687 Reims CEDEX 2
https://crestic.univ-reims.fr/fr/accueil

Document attaché : 202412201243_Sujet Master 2.docx

Categories: Stages

Call for internship proposals, M2 PSL IASD

Mar 31 – Apr 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : PSL University
Durée : 5 mois
Contact : pierre@senellart.com
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Le M2 IASD est le parcours de deuxième année en Intelligence Artificielle et Science des Données du Master Informatique de l’Université PSL (porté par l’Université Paris-Dauphine, l’École Normale Supérieure et Mines Paris). Voir https://www.masteriasd.eu/fr/ pour plus d’information.

The IASD M2 is the second-year track on Artificial Intelligence and Data Science of the Master’s degree in Computer Science of PSL University (involving Université Paris-Dauphine, École Normale Supérieure, and Mines Paris). See https://www.masteriasd.eu/ for more information.

Sujet :
… [See below for English version] …

Le master IASD lance un appel à propositions de stages pour ses étudiants pour l’année académique 2024-2025. Les stages durent 5 mois, généralement d’avril à août. Les stages peuvent se dérouler dans des laboratoires ou services de recherche académiques ou industriels mais doivent être orientés vers la recherche.

Les propositions peuvent être soumises directement via le formulaire
https://db.masteriasd.eu/internships/submit
et seront visibles sur le site web du M2 IASD

Propositions de stage

… [Voir ci-dessus pour la version française] …

The IASD M2 calls for internship proposals for its students for the 2024-2025 academic year. Internships last 5 months, typically, from April to August. Internships can be held in academic or industrial environments but must be oriented towards research.

Proposals can be submitted directly at
https://db.masteriasd.eu/internships/submit
and will be displayed on IASD’s website

List of internships proposals

Profil du candidat :

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
TBD

Categories: Stages

Deep representation of the Brain Image for the Analysis of Neurodegenerative diseases

Mar 31 – Apr 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : TIDS/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire ICube, Strasbourg
Durée : 6
Contact : seo@unistra.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Dementia with Lewy Bodies (DLB) and Alzheimer’s Disease (AD) are two common neurodegenerative diseases among elderly people. Both associated with abnormal deposits of proteins in the brain, the diagnosis of these diseases can be challenging, particularly in distinguishing between them, as they exhibit similar symptoms in their early stages. Brain MRI provides detailed images of brain structures, allowing for the identification of structural changes associated with neurodegenerative diseases. Deep learning has shown great promise in analysing these images, enabling accurate predictions and interpretations. At the center of it are the recent emerging large-scale pre-trained vision-language models (VLMs), which have demonstrated remarkable performance thanks to their generalizable visual and textual representations.

Sujet :
We will deploy a VLM to improve the accuracy and efficiency of brain image analysis, with a specific focus on classification and associated reasoning presented in text form. Our specific focus will be on the analysis and understanding of neurodegenerative diseases, Dementia with Lewy Bodies (DLB), Alzheimer’s Disease (AD), and/or Parkinson disease. We will base our study on our recent work, where the model we developed learns and refines visual, textual, and numerical representations of patient gait videos using a large-scale pre-trained Vision-Language Model (VLM) for several classification tasks.

Profil du candidat :
− Solid programming skills: Python/C++
− Experience in Deep Learning (Transformer, CLIP, etc.)
− Good communication skills

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
2 Rue Marie Hamm
67000 Strasbourg

Document attaché : 202411071344_Stage-DeBIAN.pdf

Categories: Stages

Estimating intracranial pressure by wide-band tympanometry signal analysis through neural networks

Mar 31 – Apr 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire ImViA, Dijon, France & CHU Dijon, Fran
Durée : 6 mois
Contact : franck.marzani@u-bourgogne.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Wide-band tympanometry (WBT) is a routine and non-invasive clinical tool to estimate the micromechanical properties of the middle and inner ears. The system delivers a pure-tone signal into the ear at several frequencies and records the reflecting signal in the ear canal. Il also analyses the absorbance at different pressures in the ear canal (-300 to +300 daPa). It estimates the reflectance and the absorbance of the recorded sound and thus provides interesting indicators of tympanic membrane and ossicular chain mobility, and middle ear pressure. The ear is connected to the intracranial space through the inner ear structures. An increase in the intracranial pressure (ICP) changes the micromechanical properties of the middle ear and the WBT signal. The relation between intracranial pressure and WBT signal alterations is complex and poorly studied. The WBT signal varies between individuals and these 2 obstacles hamper the estimation of intracranial pressure by WBT. Monitoring the ICP is crucial in patients undergoing intracranial surgical procedures or in those with head trauma. The gold standard for measuring ICP is invasive pressure sensors placed inside the head. Developing non-invasive ICP measurements would be a significant breakthrough in the neurosurgical field.
We have undertaken a clinical study in the intensive care unit (Dijon hospital) for the measurement of ICP with the intracranial invasive system and multiple WBT recordings on both ears in 20 patients after head trauma or surgery. The database includes 1200 recordings with corresponding invasive ICP values (ground truth). Each WBT recording is composed of absorbance values for probe sound frequencies ranging from 120 to 8000 Hz and for ear canal pressures ranging from -300 to +300 daPa).

Sujet :
The aim of the study is to develop a neural network to analyze the data and to estimate the ICP in 3 categories of pressure (low, medium, high). As a first step, the person recruited will have to understand the physical meaning of the signals handled. He/she will then have to propose and implement a deep learning architecture capable of modeling the relation between ICP and WBT signals in order to meet the objective of estimating.
This study opens insights to the understanding of the mechanisms connecting the middle ear micromechanics and ICP.

Profil du candidat :
Master or engineering student in imaging, computer vision.
Strong skills in image analysis, AI, programming such as Python.
Interest in working as part of a team in an interdisciplinarity environment. Interest in healthcare applications.
Enthusiasm for research. Autonomy.

Formation et compétences requises :
Applicants are invited to submit their application to: Franck MARZANI (franck.marzani@u-bourgogne.fr) and Alexis BOZORG GRAYELI (alexis.bozorggrayeli@chu-dijon.fr).
Application must contain the following documents: cover letter, CV, transcript of the last 2 years, at least 2 reference letters or referral contacts.

Adresse d’emploi :
Laboratoire ImViA, Dijon, Université de Bourgogne

Categories: Stages

Estimating intracranial pressure by wide-band tympanometry signal analysis through neural networks

Mar 31 – Apr 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire ImViA, Dijon, France & CHU Dijon, Fran
Durée : 6 mois
Contact : franck.marzani@u-bourgogne.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Adresse d’emploi :
Laboratoire ImViA, Dijon, Université de Bourgogne

Categories: Stages

Metalearning for Healthcare: Exploring Hierarchical Representations with Poincaré Variational Auto-Encoders

Mar 31 – Apr 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : IBISC, Univ. Évry Paris-Saclay/MIT
Durée : 6
Contact : massinissa.hamidi@univ-evry.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Context
This project will lead to concrete machine learning empirical insights intended to be exploited in the larger context of IHU Prometheus, a multi-year large-scale research and training institute for understanding sepsis disease. The student will also have the opportunity to get involved in ongoing collaboration with the IMES at MIT.

Sujet :
Project description

Machine learning is increasingly used in healthcare applications to assist medical staff in diagnosing their patients and providing tailored medications. Many real datasets in healthcare are hierarchically structured. However, traditional machine learning models map the data to Euclidean latent space, which cannot efficiently handle tree-like structures. This is the case with variational auto-encoders (VAEs), a powerful type of machine learning model that is widely used for generative purposes. In particular, they allow capturing explainable factors of variation, an important property that we seek in healthcare applications. In this project, we are interested in exploring the benefits of hierarchical representations for healthcare applications with a particular kind of VAEs which are embedded in hyperbolic spaces [1, 2].

As a starting point, we will take a look at this paper “Continuous Hierarchical Representations with Poincaré Variational Auto-Encoders” [1] and adapt it to a healthcare application. The goal is to leverage meta-knowledge [3] about the learning problem, for example, the hierarchical structure of the labels to improve the learning process. In particular, we are interested in assessing what happens for the learning process and the learned representations when choosing appropriate parameterizations (here, leveraging the hierarchical structure of the target labels) compared to when we simply map data to the Euclidean latent space, i.e., flatten the target labels and ignoring their hierarchical structure. Other VAEs that feature hyperbolic embedded spaces, such as [2, 4, 5] will also be explored and compared to basic Euclidean embedded space in terms of performances, representational properties, and learning bounds.

The experiments will be performed on the MIMIC-IV dataset [6], a freely available real-world dataset encompassing electronic health records of patients admitted to intensive care units. The idea is to adapt one of the healthcare learning problems featured in MIMIC-IV dataset to a hierarchical representation learning problem.

We seek to publish the obtained results in machine learning and machine learning for healthcare related workshops or conference venues.

Contact
Massinissa HAMIDI
Maître de conférences
IBISC Laboratory, Univ. Évry Paris-Saclay massinissa.hamidi@univ-evry.fr

Li-wei H. LEHMAN
Research Scientist
Massachusetts Institute of Technology lilehman@mit.edu

Bibliography
[1] Mathieu E, Le Lan C, Maddison CJ, Tomioka R, Teh YW. Continuous hierarchical representations with poincaré variational auto-encoders. Advances in neural information processing systems. 2019;32.

[2] Bose, Joey, et al. “Latent variable modelling with hyperbolic normalizing flows.” International conference on machine learning. PMLR, 2020.

[3] Hamidi, Massinissa. Metalearning guided by domain knowledge in distributed and decentralized applications. Diss. Université Paris-Nord-Paris XIII, 2022.

[4] Davidson, Tim R., et al. “Hyperspherical variational auto-encoders.” 34th Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence 2018, UAI 2018. Association For Uncertainty in Artificial Intelligence (AUAI), 2018.

[5] Cho, Seunghyuk, Juyong Lee, and Dongwoo Kim. “Hyperbolic VAE via latent Gaussian distributions.” Advances in Neural Information Processing Systems 36 (2024).

[6] A. E. Johnson, L. Bulgarelli, L. Shen, A. Gayles, A. Shammout, S. Horng, T. J. Pollard, S. Hao, B. Moody, B. Gow, et al. Mimic-iv, a freely accessible electronic health record dataset. Scientific data, 10(1):1, 2023.

Profil du candidat :
Niveau Master, MSc ou Programme Grande Ecole

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
23 Bd de France-Georges Pompidou, 91037 Évry-Courcouronnes

Document attaché : 202412191341_2425-UPSay-MIT-internship-Metalearning-Poincare-VAE.pdf

Categories: Stages

Offre de stage M2 – Projet CALYPSO (Clinique et AnaLYses PSychiatriques Objectives)

Mar 31 – Apr 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : TIDS/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire CRIStAL (Université de Lille)
Durée : 12 semaines minimum
Contact : mathilde.regue@univ-lille.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Le projet CALYPSO : Vers une psychiatrie de précision
CALYPSO est un projet de recherche interdisciplinaire de l’Université de Lille qui réunit des chercheurs en intelligence artificielle, psychiatrie, psychologie et neurosciences issus du laboratoire CRIStAL, du centre Lille Neuroscience et Cognition et du SCALab. Le projet CALYPSO vise à identifier des marqueurs objectifs des troubles psychiatriques pour améliorer la précision des diagnostics, la prédiction du pronostic et de la réponse aux traitements, et personnaliser les interventions.

Contexte sociétal du projet :

Les troubles psychiatriques touchent aujourd’hui près d’une personne sur huit dans le monde, faisant de la santé mentale un enjeu majeur de santé publique. Cette situation s’intensifie face aux crises globales qui amplifient la prévalence des troubles tels que la dépression et le trouble de stress post-traumatique (TSPT). Bien que la recherche en psychiatrie ait permis des avancées significatives, les mécanismes sous-jacents à ces troubles demeurent encore peu voire pas connus, et les découvertes peinent souvent à se traduire dans la pratique clinique.

Quelques chiffres… L’ampleur des troubles visés par CALYPSO

*300 millions : Nombre de personnes affectées par la dépression dans le monde
*70 % : Proportion des individus exposés à des événements potentiellement traumatiques au cours de leur vie
*24 % : Prévalence du TSPT suite à un événement traumatique

Description du projet CALYPSO :

Le projet CALYPSO vise à enrichir la définition des troubles psychiatriques grâce à des marqueurs objectifs, rendus possibles par les technologies d’intelligence artificielle et de vision par ordinateur. Les marqueurs objectifs incluent des indicateurs mesurables et quantifiables tels que les expressions faciales, les tonalités de voix, les comportements moteurs, et les données physiologiques (par exemple, rythme cardiaque, respiration). En permettant d’étudier des groupes de patients plus homogènes, ces avancées offriraient une voie vers des traitements plus ciblés, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives pour répondre aux besoins spécifiques de chaque patient.

Sujet :
Missions du stage:

Durant ce stage, l’étudiant ou l’étudiante s’intéressera au développement de méthodes de machine learning adaptées au projet.

Ses missions seront :

*Développer et mettre en œuvre un algorithme d’analyse pour un des marqueurs objectifs enregistrés (expressions faciales / mouvements du visage / vitesse de déplacement / analyse de la voix…).
*Utiliser des techniques d’apprentissage automatique pour identifier des sous-groupes de patients en fonction des marqueurs objectifs.
*Effectuer des évaluations expérimentales des algorithmes et techniques développés.
*Discuter avec des équipes interdisciplinaires pour intégrer les résultats dans la pratique clinique.

Profil du candidat :
Étudiant ou étudiante en M2 dans un Master en informatique, en intelligence artificielle, ou dans un domaine connexe.

Formation et compétences requises :
*Connaissance en vision par ordinateur, apprentissage automatique et intelligence artificielle.
*Connaissance de travail avec des ensembles de données à grande échelle et de réalisation d’évaluations expérimentales.
*Compétences en programmation en Python. Une connaissance des bibliothèques de vision par ordinateur telles que OpenCV, TensorFlow, PyTorch ou similaires serait un avantage.
*Compétences analytiques et en résolution de problèmes.

Adresse d’emploi :
Infos pratiques :
La durée du stage sera de minimum 12 semaines.
Le projet sera encadré par les Pr. Mohamed Daoudi (UMR 9189 CRIStAL – Computer Science et AI), Pr Ali Amad (UMR-S 1172 et CHU de Lille –Psychiatrie) et Dr Fabien D’Hondt (UMR-S 1172 – Neurosciences).
Le stagiaire sera principalement localisé dans les locaux du laboratoire CRIStAL, campus Cité Scientifique et ponctuellement au centre Lille Neuroscience et Cognition.

Contact : Pour postuler à cette offre, merci d’envoyer un CV ainsi qu’une lettre de présentation à : mathilde.regue@univ-lille.fr

Document attaché : 202412190951_Offre de stage M2 – Projet CALYPSO.pdf

Categories: Stages

Thu

Développement d’une application web pour traiter et stocker les données d’histologie Raman stimulée.

Apr 3 – Apr 4 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Institut Fresnel
Durée : Flexible
Contact : andre@fresnel.fr
Date limite de publication : 2025-04-03

Contexte :
L’histologie joue un rôle crucial dans le diagnostic des tumeurs cérébrales, car elle implique l’extraction et l’analyse d’un échantillon de tissu. La méthode classique pour l’analyse des biopsies est la coloration à l’hématoxyline et à l’éosine (H&E), qui aide les experts à identifier les tissus cancéreux, mais qui peut prendre beaucoup de temps. Une technique alternative, plus rapide, appelée Histologie Raman Stimulée (SRH) est apparue, produisant des images comparables à la coloration H&E. Cette technique permet d’imager les liaisons chimiques CH2 et CH3, et la soustraction de ces deux canaux (CH3-CH2) est utilisée pour mettre en évidence les noyaux des tissus. Ces images sont ensuite traitées, assemblées et mises en correspondance avec un code couleur de type H&E à l’aide d’outils de colorisation virtuel.

Sujet :
Le candidat devra modifier et améliorer une application web existante qui effectue les différents traitements aux images brutes afin de générer des images SRH de haute qualité. La tâche principale consiste à concevoir et à construire une nouvelle application robuste axée uniquement sur la coloration virtuelle en garantissant des performances et une réactivité élevée.

Profil du candidat :
Développement d’applications web, en particulier dans le domaine de l’analyse d’images ou dans des domaines connexes.
Maîtrise des technologies frontales et dorsales (par exemple, HTML, CSS, JavaScript, Python).
Expérience avec SQL ou un autre système de gestion de base de données (MongoDB).
Expérience avec des bibliothèques de traitement d’images (par exemple, OpenCV, Scikit-image).
Appétence pour la résolution de problèmes informatiques et souci du détail.
Forte aptitude de communication et travail en équipe.

Formation et compétences requises :
Etudiant de Bac+2 à Bac+5 en informatique ayant un fort intérêt pour le développement web.

Adresse d’emploi :
Institut Fresnel, 52 Av. Escadrille Normandie Niemen, 13013 Marseille

Document attaché : 202409031543_offre_stage_interface Web.pdf

Categories: Stages

Fri

Amélioration de la performance des modèles d’apprentissage fédéré à l’Aide de métaheuristiques

Apr 4 – Apr 5 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : LAMSADE – Dauphine PSL
Durée : 4 à 6 mois
Contact : sana.mrabet@dauphine.psl.eu
Date limite de publication : 2025-04-04

Contexte :
L’apprentissage fédéré (Federated Learning, FL) est une approche de l’apprentissage machine décentralisé où les modèles sont entraînés localement sur plusieurs appareils sans partager les données brutes, préservant ainsi la confidentialité et réduisant les coûts de communication. Ce paradigme est de plus en plus utilisé dans des domaines sensibles comme la santé, la finance ou encore les appareils connectés. Cependant, il pose des défis uniques, notamment :
• L’hétérogénéité des données entre les participants,
• L’optimisation efficace des modèles sur des ensembles de données distribués et déséquilibrés,
• La communication coûteuse entre les participants et le serveur central.

Sujet :
Ce sujet vise à développer des approches innovantes pour améliorer la performance des modèles d’apprentissage fédéré. Il s’agira d’explorer des méthodes hybrides mêlant l’intégration de méta-heuristiques (ex. : colonies de fourmis, algorithmes génétiques) pour :
• Identifier dynamiquement les sous-ensembles d’appareils participant à chaque cycle, maximisant ainsi la performance globale du modèle tout en respectant les contraintes du système.
• Optimiser la sélection dynamique des modèles locaux contribuant efficacement à la performance globale.
• Optimiser les stratégies d’agrégation des poids pour gérer le déséquilibre des données et améliorer la convergence.

Profil du candidat :
L’offre s’adresse à un étudiant en M2 ou équivalent en Informatique, avec bonnes connaissances en Machine Learning et en programmation Python.

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
LAMADE – Université Paris Dauphine – PSL
Place du Maréchal de Lattre de Tassigny – 75775 PARIS Cedex 16

Document attaché : 202501131418_Projet master recherche – FL – 2025.pdf

Categories: Stages

Reconnaissance et Suivi de Démarche à Travers des Vidéos Multi-Vues

Apr 4 – Apr 5 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : GREYC
Durée : 5 mois
Contact : alexis.mortelier@unicaen.fr
Date limite de publication : 2025-04-04

Contexte :
La reconnaissance de démarche est une technique biométrique utilisée pour identifier ou suivre une personne en analysant ses mouvements. Ce domaine trouve des applications dans la sécurité, la surveillance, et l’interaction homme-machine. Cependant, les défis restent nombreux, notamment dans des environnements réels où des variations d’angle de caméra, de vêtements ou de conditions d’éclairage peuvent affecter la robustesse des algorithmes.

Ce stage s’inscrit dans les travaux récents sur l’analyse et le suivi de démarche en exploitant des approches modernes basées sur des données spatio-temporelles et des modèles d’apprentissage automatique. Des études comme celles sur OpenGait, Gait Parsing Sequence (GPS) et la reconnaissance en conditions de changement de vêtements fournissent des bases pour ce sujet

Sujet :
Pour ce stage, votre objectif sera de développer un système capable de reconnaître une personne à partir de sa démarche, indépendamment des variations de vêtements ou d’angles de caméra, et de suivre cette personne à travers plusieurs vidéos en exploitant des caractéristiques robustes et discriminantes.

Vous commencerez par explorer les méthodes existantes. Analysez les approches actuelles en reconnaissance de démarche, notamment des solutions comme GaitSet, GPS et OpenGait. Étudiez les ensembles de données pertinents, tels que GREW, CASIA-B, et Gait3D, pour comprendre les défis et les méthodologies en vigueur. Identifiez les limites des solutions actuelles et les opportunités d’amélioration.

Ensuite, vous concevrez et implémenterez un pipeline de reconnaissance basé sur des architectures modernes, telles que les réseaux convolutionnels 3D ou les transformers. Intégrerez des mécanismes spécifiques pour traiter les changements d’apparence (par exemple, les variations de vêtements) et les variations d’angles. Vous utiliserez des frameworks comme PyTorch ou TensorFlow pour entraîner et optimiser votre modèle, en veillant à garantir robustesse et efficacité.

Après le développement, vous évaluerez votre modèle en réalisant des tests approfondis sur des ensembles de données publics. Comparerez ses performances avec les méthodes de l’état de l’art, en termes de précision, de robustesse et de temps de calcul. Vous identifierez les points forts et faibles de votre approche pour orienter d’éventuelles améliorations.

Enfin, vous documenterez votre travail en rédigeant un rapport détaillé en présentant les méthodologies utilisées, les résultats obtenus, et proposerez des pistes d’amélioration.

N’oubliez pas d’intégrer des idées pour des applications pratiques, notamment dans des contextes en temps réel. Soyez méthodique, rigoureux et force de proposition tout au long de ce stage.

Profil du candidat :
Master/Ingénieur dernière année en informatique, traitement du signal et des images, biométrie

Formation et compétences requises :
– apprentissage profond (modèles spatio-temporels, CNN, transformers).
– traitement d’images
– familiarité avec les concepts de biométrie ou d’analyse de mouvement serait un plus.
– compétences en programmation Python, OpenCV, Tensorflow, PyTorch.

Adresse d’emploi :
laboratoire GREYC site de Caen (Campus 2, 6 boulevard maréchal juin) et/ou Saint-Lô (IUT GON, 120 Rue de l’Exode, 50000 Saint-Lô)

Document attaché : 202501141533_Stage_M2__2025_biométrie_SAFE.pdf

Categories: Stages

Revisiting PCA with norm-ratio sparsity penalties

Apr 4 – Apr 5 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : INRIA Opis
Durée : 5 mois
Contact : laurent.duval@ifpen.fr
Date limite de publication : 2025-04-04

Contexte :
In the context of the ERC MAJORIS, and in collaboration with IFPEN company, the aim of this internship is to investigate the problem of sparse principal component analysis (PCA), with norm-ratio sparsifying penalties. Online information:

https://jobs.inria.fr/public/classic/fr/offres/2024-08488

Sujet :
Principal component analysis (PCA) is a workhorse in linear dimensionality reduction [Jol02]. It is widely applied in exploratory data analysis, visualization, data preprocessing).
Principal components are usually linear combinations of all input variables. For high-dimension data, this may involve input variables that contribute very little to the understanding. Finding the few directions in space that explain best observations is desirable. Sparse PCA overcomes this disadvantage by finding linear combinations that contain just a few input variables, by adding sparsity constraints [CR24,ZX18]. One of such is formulated (cf. lasso) with the help of an absolute norm penalty/regularization. In [MBPS10], one designs this matrix factorization problem as:

minimize_{alpha} || X – D alpha ||^2_F + lambda|| alpha ||_{1,1}

where: X = [x_1,…,x_n] is the matrix of data vectors; D is a square matrix from a suitable basis set, ||.||_F denotes the Frobenius norm; ||.||_{1,1} denotes the sum of the magnitude of matrix coefficients, lambda is a positive penalty weight.

A penalty such as ||.||_{1,1} is 1-homogeneous. This may only weakly emulate the sheer count of non-zero entries of a matrix, that would be scale-invariant or 0-homogeneous.

Recently, the SOOT/SPOQ family of penalties has been developed in our research group, as smooth emulations to the scale-invariant lp/lq norm ratios. The latter had been used for a while, as stopping-criteria, penalties or “continuous” sparsity count estimators [HR09]. They have been used successfully for the restoration/deconvolution/source separation of sparse signals [CCDP20,RPD+15].

The goal of the internship is to investigate the resolution of sparse PCA models, by replacing the standard l1 norm by such norm ratios. Convergence analysis of the proposed optimization algorithm, imlementation and validation over public benchmarks will be conducted.

[CCDP20] Afef Cherni, Emilie Chouzenoux, Laurent Duval, and Jean-Christophe Pesquet. SPOQ ℓp-over-ℓq regularization for sparse signal
recovery applied to mass spectrometry. IEEE Trans. Signal Process., 68:6070–6084, 2020.
[CR24] Fan Chen and Karl Rohe. A new basis for sparse principal component analysis. J. Comp. Graph. Stat.), 33(2):421–434, 2024.
[HR09] N. Hurley and S. Rickard. Comparing measures of sparsity. IEEE Trans. Inform. Theory, 55(10):4723–4741, Oct. 2009.
[Jol02] I. T. Jolliffe. Principal component analysis. Springer Series in Statistics, 2nd edition, 2002.
[MBPS10] Julien Mairal, Francis Bach, Jean Ponce, and Guillermo Sapiro. Online learning for matrix factorization and sparse coding. J. Mach.
Learn. Res., 11:19–60, 2010.
[RPD+15] A. Repetti, M. Q. Pham, L. Duval, E. Chouzenoux, and J.-C. Pesquet. Euclid in a taxicab: Sparse blind deconvolution with smoothed
ℓ1/ℓ2 regularization. IEEE Signal Process. Lett., 22(5):539–543, May 2015.
[ZCD23] Paul Zheng, Emilie Chouzenoux, and Laurent Duval. PENDANTSS: PEnalized Norm-ratios Disentangling Additive Noise, Trend
and Sparse Spikes. IEEE Signal Process. Lett., 30:215–219, 2023.
[ZX18] Hui Zou and Lingzhou Xue. A selective overview of sparse principal component analysis. Proc. IEEE, 106(8):1311–1320, August
2018.

Profil du candidat :
We seek for a talented candidate in Master 1, Master 2, or Engineering studies

Formation et compétences requises :
A solid background in optimization, and signal processing, and a strong motivation for research and innovation. Experience in Python is necessary.

Adresse d’emploi :
INRIA Saclay

Document attaché : 202501132057_main-IFPEN-INRIA-master-pca-spoq-sparse-revisited.pdf

Categories: Stages

Tue

IA générative pour conception de tableau de bord – Jeux video

Apr 15 – Apr 16 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : GREYC/GAMPAM
Durée : 4 à 6 mois
Contact : francois.rioult@unicaen.fr
Date limite de publication : 2025-04-15

Contexte :
GAMPAM est une entreprise spécialisée dans le développement de jeux web et mobiles. Parmi ses domaines d’intérêt figurent la création d’edugames, une catégorie de jeux dédiée à l’apprentissage et à la pédagogie, ainsi que la création de jeux en ligne.

Les motivations de GAMPAM sont de proposer un service no-code de développement assisté par IA pour concevoir les jeux, leurs mécaniques et leurs graphismes.

Sujet :
Les récents développements en IA générative permettent l’exécution de prompts complexes pour la création de données structurées. L’ingénierie du prompt peut ainsi être abordée comme une recherche dans un espace vectoriel de programmes [1]. De plus, l’enrichissement du prompt par construction automatique d’une chaîne de pensée simule un raisonnement approfondissant les résultats usuels [2].

Pour spécialiser la base de connaissances du modèle, des techniques de RAG [3] permettent d’enrichir le prompt grâce aux résultats de l’interrogation de cette base. Des techniques de distillation sont également utiles [4] pour transférer les connaissances d’un grand modèle superviseur vers un modèle compact.

L’étudiant(e) réalisera une synthèse de l’état de l’art en matière de RAG et de distillation. Il/elle mettra en œuvre un processus de distillation pour obtenir un modèle compact capable de générer un tableau de bord à l’aide d’un langage maison, BoxLang, dédié à la création d’interfaces de contrôle.

Profil du candidat :
Étudiant(e) de master 2 en informatique ou 3è année d’école d’ingénieur.

Formation et compétences requises :
– Maîtrise du JavaScript (vanilla),
– Bases solides en algorithmie,
– Intérêt pour l’abstraction, la généralisation et la conception de jeux,
– Bonne culture de l’IA, en particulier les LLM et leurs applications
– Bon niveau d’anglais (lu, écrit, parlé)

Adresse d’emploi :
Caen (GREYC ou GAMPAM)

Document attaché : 202502271516_fiche-de-poste-m2-greyc.pdf

Categories: Stages

Stage IA en cancérologie avec la possibilité de poursuivre en thèse

Apr 15 – Apr 16 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Sesstim, Aix Marseille Université
Durée : 6 Mois
Contact : raquel.urena@univ-amu.fr
Date limite de publication : 2025-04-15

Contexte :
Ce stage s’inscrit dans un projet de recherche visant à intégrer des données cliniques, d’imagerie, et génomiques pour construire une base de données avancée en oncologie. Le but est de faciliter l’analyse des données et d’améliorer les prédictions sur la survie et la récidive du cancer du sein.

Sujet :
Le stagiaire sera impliqué dans :
1. Collecte et nettoyage des données : Extraction et harmonisation de données issues de multiples sources.
2. Constitution de la base de données : Conception et structuration d’un entrepôt de données robuste pour des analyses futures.
3. Application de techniques d’intelligence artificielle : Détection d’anomalies, fusion de données, et analyse prédictive avec des algorithmes de machine learning.

Profil du candidat :
• Étudiant(e) en Master 2 en Sciences des Données, Informatique ou équivalent.
• Connaissances solides en Python et en bases de données (SQL, NoSQL).
• Intérêt pour le traitement des données en santé et la bio-informatique

Formation et compétences requises :
Machine learning, SQL, Sciences des données

Adresse d’emploi :
Institut Paoli Calmettes, : 232 Bd de Sainte-Marguerite, 13009 Marseille

Document attaché : 202503101036_Offre de Stage 2025.pdf

Categories: Stages

Wed

DADY : un modèle fondation de réseau de neurones pour l’observation aérienne time-lapse de systèmes agroécologiques au Sud

Apr 30 – May 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : CIRAD Montpellier
Durée : 6 mois
Contact : romain.fernandez@cirad.fr
Date limite de publication : 2025-04-30

Contexte :
Le projet DeepAeroDynamics (DADY) vise à combiner l’imagerie drone multispectrale time-lapse et le deep learning pour faire face aux défis du changement climatique et de la sécurité alimentaire dans les pays du Sud. L’objectif est de développer un modèle fondation capable d’intégrer les données multispectrales, spatiales et temporelles observées par drone aérien dans des environnements complexes et hétérogènes du Sud dans le but d’anticiper et prédire le comportement de plantes cultivées en agroécologie (Sahel, Madagascar, Guadeloupe).

Sujet :
Le stagiaire sera au coeur du développement d’une architecture deep learning permettant :
* D’analyser des séries temporelles multispectrales d’imagerie drone, et extraire automatiquement des représentations informatives de l’état des systèmes observés.
* D’analyser les dynamiques temporelles en utilisant des modèles de type Transformers pour capturer les évolutions des cultures décrites dans un espace latent.
* De maximiser l’utilisation des données par des techniques d’apprentissage semi-supervisées et des consignes prétextes pour maximiser la capacité d’apprentissage de l’architecture fondation.

Le développement des modèles s’appuiera sur des architectures CNN et Transformers. L’approche sera validée sur des jeux de données déjà acquis et stockés à proximité d’un supercalculateur. Les tests de niveau 1 s’effectueront sur une ferme GPU locale, et les modèles de niveau 2 seront testés sur les supercalculateurs Jean Zay et Adastra (20e mondial au TOP500). Les modèles seront documentés et diffusés en open-source, accompagnés de scripts pour le fine-tuning.

Profil du candidat :
Étudiant·e en Master 2 ou école d’ingénieur avec spécialisation en deep learning.

Formation et compétences requises :
Travail avec Python, Pytorch/Tensorflow, Github, Intégration Continue. Expérience en traitement d’images. Capacité à travailler en équipe dans un environnement mêlant informatique, biologie et agroécologie.

Adresse d’emploi :
La rémunération selon barème légal des stages sera de 600€ mensuel, avec accès à la restauration collective le midi. Le stage aura lieu au Cirad de Montpellier, 389 Av. Agropolis, 34980 Montferrier-sur-Lez.

Document attaché : 202412131037_Offre de stage M2 – 2025 – DADY.pdf

Categories: Stages

Extraction d’attributs pertinents à partir d’images pour la caractérisation du cancer du sein par les techniques d’apprentissage automatique.

Apr 30 – May 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire IBISC, Université d’Evry Paris-Saclay
Durée : 5-6 mois
Contact : Khalifa.Djemal@ibisc.univ-evry.fr
Date limite de publication : 2025-04-30

Contexte :

Sujet :
Description du sujet:

Le cancer du sein est considéré dans le monde comme la première cause de mortalité parmi les différentes localisations du cancer chez les femmes. Malgré les progrès importants réalisés ces dernières décennies pour améliorer la gestion de ce type de cancer, des outils de diagnostic plus précis sont encore nécessaires pour aider les experts à lutter contre cette maladie mortelle. De nombreux travaux ont été menés pour détecter la présence de tissus cancéreux dans le sein et pour la classification tumorale, en utilisant des outils dérivés de l’intelligence artificielle, souvent inspirés des systèmes naturels. En effet, des études récentes ont été publiées et plusieurs outils ont été développés, essentiellement basés sur l’apprentissage automatique, pour identifier et catégoriser automatiquement les masses mammaires malignes. Dans ce travail, nous nous concentrons sur l’extraction des attributs caractérisant les masses mammaires malignes, en tenant compte des paramètres environnementaux, tels que la pollution atmosphérique. Après une étude approfondie des méthodes récentes, le candidat développera une méthode basée sur les approches d’apprentissage automatique. La méthode développée permettra l’identification du cancer du sein et facilitera la prise de décision. La validation de la méthode proposée sera effectuée sur des bases de données connues.
Références:

[1] Peikari, M., Salama, S., Nofech-Mozes, S. and Martel, A.L., 2017. Automatic cellularity assessment from post-treated breast surgical specimens. Cytometry Part A, 91(11), pp.1078-1087.

[2] P. Khosravi, E. Kazemi, M. Imielinski, O. Elemento, and I. Hajirasouliha, Deep convolutional neural networks enable discrimination of heterogeneous digital pathology images,EBioMedicine, vol. 27, pp. 317 – 328, 2018.

[3] Adel Abdelli, Rachida Saouli, Khalifa Djemal, Imane Youkana, Combined Datasets For Breast Cancer Grading Based On Multi-CNN Architectures. 10th IEEE International conference on Image processing Theory, Tools and Applications IPTA 2020, November 09-12, Paris, France.

[4] Rima Daoudi and Khalifa Djemal, Breast Cancer Classification by Artificial Immune Algorithm based Validity Interval Cells Selection, Proceedings of ECTA 2016, ISBN: 978-989-758-201-1, Porto, Portugal, 9-11 november 2016.

[5] Konstantinos Charalampous and Antonios Gasteratos, Bio-inspired Deep Learning Model for Object Recognition, IEEE International Conference on Imaging Systems and Techniques (IST), pages:51 – 55, October 22-23, Beijing, china, 2013.

[6] S.R. Kheradpisheh, M. Ganjtabesh, and T. Masquelier, Bio-inspired unsupervised learning of visual features leads to robust invariant object recognition. Neurocomputing 205 (2016), pages: 382-392.

[7] https://www.acr.org

Profil du candidat :
Sujet de stage pour Master 2 ou équivalent, de préférence des spécialités suivantes :
– Machine Learning
– Imagerie Biomédicale
– Informatique Biomédicale

Formation et compétences requises :
– Programmation Python, Matlab,
– Machine Learning
– Des connaissances de base en traitement d’images

Adresse d’emploi :
Université d’Evry Paris Saclay
Laboratoire Informatique, Biologie Intégrative et Systèmes Complexes – IBISC, 40 rue du Pelvoux, 91020 Evry, France.

Document attaché : 202503170951_Sujet-Stage-Master2-CS-2024-2025.pdf

Categories: Stages

Extraction et structuration des informations d’évolution des rues dans des corpus textuels à l’aide de grands modèles de langue

Apr 30 – May 1 all-day

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : DOING/– — –

Laboratoire/Entreprise : LaSTIG (Université Gustave Eiffel – IGN/ENSG)
Durée : 5 mois
Contact : charly.bernard@ign.fr
Date limite de publication : 2025-04-30

Contexte :

Sujet :
Ce stage s’inscrit dans un ensemble de travaux visant à proposer une méthodologie générique et reproductible pour la construction d’un graphe de connaissances géohistorique des voies et des adresses à partir des documents historiques et de données publiées sur le Web.

Profil du candidat :

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
Équipe LaSTIG/Strudel – École Nationale des Sciences Géographiques
6-8 avenue Blaise Pascal
77420 Champs-sur-Marne
(RER A, station Noisy-Champs)

Document attaché : 202412131314_2025-Sujet_Stage_M2_LLM_Rues_Paris.pdf

Categories: Stages

May

Sun

Détection automatique d’interaction médicamenteuse en réanimation médicale