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Laboratoire/Entreprise : ERIC
Durée : 6 mois
Contact : jairo.cugliari@univ-lyon2.fr
Date limite de publication : 2020-12-31

Contexte :
En France, l’étude menée en 2016 par Santé Publique France a estimé à 48 000 le nombre de décès prématurés attribuables à la pollution de l’air (Pascal, 2016). Le Centre International de Recherche sur le Cancer (CIRC) a classé la pollution de l’air extérieur dans son ensemble et les particules fines en particulier, comme cancérogènes pour l’homme, avec des indications suffisantes pour un lien avec le cancer du poumon et des associations positives avec le cancer de la vessie (IARC Working Group on the Evaluation of Carcinogenic Risks to Humans, 2012).
C’est dans ce contexte que travaille depuis des années le Département Prévention Cancer Environnement du Centre Léon Bérard avec différents partenaires (e.g. Laboratoire de Mécanique des Fluides et d’Acoustique (UMR CNRS 5509 LMFA – École Centrale), Laboratoire Environnement Ville Société (UMR CNRS 5600 EVS – Lyon2/Lyon3) ou encore le Laboratoire d’Informatique (UMR CNRS 5205 LIRIS – Lyon2), l’INERIS ou encore Santé
Publique France) sur des études épidémiologiques sur les facteurs de risques environnementaux liés à différents cancers hormonaux (e.g. sein, testicule, etc.).
À titre d’illustration, pour le cancer du sein, le plus fréquent chez la femme, les causes environnementales et notamment l’exposition chronique à la pollution de l’air sont suspectées d’avoir un impact sur son incidence. En effet le dépistage, le vieillissement de la population et les facteurs de risque liés au mode de vie (alcool, alimentation, etc.) ne permettent pas d’expliquer à eux seuls les variations géographiques des taux d’incidence, et incitent, dès lors, à investiguer ces causes environnementales.
Dans le cadre d’une étude sur le risque de cancer du sien associée à l’exposition à la pollution de l’air, une simulation des concentrations de 8 polluants atmosphérique sur le territoire français a été réalisée via le modèle CHIMERE (modèle chimie-transport développé par l’INERIS). Nous disposons donc des concentrations horaires pour 8 polluants pour une
résolution fine (0,0625° x 0,125° soit environ 8 x 8 km) sur 21 ans 1990-2010.
Ce jeu de données permet d’analyser les expositions individuelles tout au long de la période pour les sujets d’études. La précision temporelle et la couverture spatiale permettent l’étude individuelle sur la période d’étude en suivant les parcours de vie : succession des lieux de résidence et des lieux de travail mais aussi les mobilités quotidiennes et prochainement
l’ensemble des autres activités quotidiennes (loisirs, visites, etc.) ainsi que des mobilités induites.
Néanmoins, ces données demeurent pour l’instant sous-exploitées notamment quant aux modèles spatio-temporels intrinsèques particulièrement aux niveaux les plus fins.
Dans ce contexte, le stage a pour objectif de contribuer, au sein d’un partenariat inédit entre le Centre Léon Bérard et le laboratoire ERIC, spécialisé en exploration de données temporelles, d’appréhender les modèles temporels et spatiaux sous-jacents permettant la synthèse et dès
lors l’exploitation routinière de ces données massives dans le cadre des présents et futurs projets épidémiologiques.

Sujet :
Vous serez chargé de la mise en place d’une méthodologie pour explorer des données spatio-temporelles complexes dans le but de proposer une/des synthèse·s de ces données singulières ou plurielles. Les données présentent plusieurs caractéristiques d’intérêt, ce sont de données multivariées avec une structure spatio-temporelle et la présence de phénomènes extrêmes. Il est envisagé que la personne recrutée exploite le plus grand nombre de ces caractéristiques dans les analyses. Une liste non exhaustive de missions du stage suit :
• Exploration statique des données horaires infra- et inter-polluant pour la détermination de profils types de pollution
• Analyse spatiale des polluants afin de déterminer les profils d’interactions
• Modélisation de la structure spatio-temporelle (par exemple en utilisant modèles additifs ou de données fonctionnelles)
• Caractériser les épisodes de concentration liés aux interactions de plusieurs polluants

Profil du candidat :
* Rigueur scientifique, capacité d’innovation et de synthèse.
* Capacité à lire et comprendre la littérature internationale (maîtrise de l’anglais scientifique)
* Maîtrise d’au moins un logiciel d’analyse de données (R, Python)
* Autonomie, bonnes qualités relationnelles et capacité à travailler en équipe
pluridisciplinaire

Formation et compétences requises :
Étudiant·e de M2 à orientation data science

Adresse d’emploi :
Laboratoire ERIC | Université Lumière Lyon 2 (5 avenue Pierre Mendès France, 69676 Bron, https://eric.msh-lse.fr/)

Merci d’adresser, votre candidature avec un CV, une lettre de motivation ainsi que vos notes de l’année universitaire en cours et de l’année dernière à Leny.Grassot@lyon.unicancer.fr, Thomas.Coudon@lyon.unicancer.fr et Jairo.Cugliari@univ-lyon2.fr.

Document attaché : 202011261447_OffreStageM2_CLB-ERIC_2021.pdf

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Laboratoire/Entreprise : Rman Sync
Durée : 6 mois
Contact : francois.rioult@unicaen.fr
Date limite de publication : 2021-01-01

Contexte :
Rman Sync est une startup spécialisée dans la transformation numérique des PME. Pour cela nous développons des solutions autour du Saas et de l’intelligence artificielle. Notre ambition et d’utiliser l’intelligence artificielle au quotidien en laissant l’humain prendre les bonnes décisions.

Sujet :
Pour simplifier ses interfaces graphiques, Rman Sync souhaite réaliser de la reconnaissance de texte de règles métiers en langue française.
Cette reconnaissance devra permettre la construction de règles de gestion « compréhensible » par un système expert defini.
Par exemple une règle du type « 3% de remise sur le rayon Lego sur la période de Noel » devra aboutir à la définition de la règle suivante :

regle.type(VENTE)
.trigger(Ligne.class)
.trigger(Produit.class).plv(“Lego”)
.until(new Event(« Periode de Noel »))
.mark(Remise.class).coef(new BigDecimal(“0.03”));

Dans ce cadre, le stage consistera à concevoir et à déployer un réseau “Named Entity Recognition” afin de permettre de créer un pipeline de transformation du texte en déclenchement de règles expertes.

Profil du candidat :
M2 / ingénieur en science des données – TAL

Formation et compétences requises :
Science des données
Traitement automatique de la langue
Reconnaissance d’entités nommées

Adresse d’emploi :
Caen

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Laboratoire/Entreprise : LS2N Université de Nantes / Capacités
Durée : 5-6 mois
Contact : pierre-hugues.joalland@univ-nantes.fr
Date limite de publication : 1/3/2021

Contexte :
Capacités – filiale privée de l’Université de Nantes – valorise les travaux des laboratoires universitaires et accompagne les entreprises dans leurs projets innovants. L’entité KnowEdge collabore en lien étroit avec l’équipe DUKe du laboratoire LS2N dans le domaine de l’IA :
– construction et manipulation de modèles de connaissances
– réseaux bayésiens et modèles graphiques d’événements
PILGRIM est une librairie utilisée par de multiples projets : systèmes de recommandation, modèles de vieillissement, assistants médicaux personnalisés (https://www.lesechos.fr/pme-regions/innovateurs/capacites-cree-une-application-contre-la-recidive-du-suicide-1265447)

Sujet :
Nous recherchons un(e) stagiaire pour participer au développement d’applications Web en vue d’illustrer deux cas d’utilisation de PILGRIM :
– l’aide à la décision pour un réseau de capteurs connectés
– la simulation du vieillissement d’un champ d’éoliennes

Profil du candidat :
-> Savoir-faire technique en architecture client / serveur et développement d’applications Web
-> Autonomie dans l’organisation du travail
-> Intérêt pour l’IA, le machine learning

-> rémunération 1500 € net mensuel

Formation et compétences requises :
-> Bac + 5 Informatique
-> Développement d’applications Web
-> Compétences en C++, Python, binding SIP, API, Swagger, Flask, RQ, Redis, Git
-> Maîtrise de l’anglais

Adresse d’emploi :
Polytech’ Nantes
Campus de La Chantrerie
NANTES

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Laboratoire/Entreprise : Cirad
Durée : 6 mois
Contact : pierre.martin@cirad.fr
Date limite de publication : 01/03/2021

Contexte :
Le projet ASSET (Agroecology and Safe food System Transitions in Southeast Asia), coordonné par le Cirad et le Gret, a pour objectif d’accompagner et de promouvoir les approches territoriales de l’innovation, en partenariat avec l’ensemble des acteurs et en tirer des enseignements par une évaluation de leurs performances et impacts (2020-2025). Parmi ses activités, ASSET souhaite transformer une librairie existante en ligne ALiSEA (https://ali-sea.org) conçue pour des acteurs de la sous-région (Myanmar, Cambodge, Vietnam et Laos) en une plateforme de partage et de diffusion plus large des connaissances sur l’agroécologie, enrichie notamment par des travaux de recherche et d’experts, des traductions, des documents pratiques ou de vulgarisation, etc. Le corpus d’ALiSEA comporte actuellement 900 documents en anglais classés selon 6 approches de l’agroécologie, le pays et le type de document. Pour permettre la navigation au sein de ce corpus et accéder aux connaissances, la plateforme souhaite se doter d’un thésaurus documentaire. L’enjeu du stage est d’élaborer une première version de ce thésaurus.

La plateforme logicielle KEOPS (Knowledge ExtractOr Pipeline System) a, entre autres, été retenue pour instrumenter le développement de ce thésaurus. Cette plateforme logicielle propose différentes méthodes d’indexation de documents (en utilisant des mots clés libres ou un thésaurus, fouille de données basée sur un traitement lexical, etc.) et de classification.

Sujet :
L’objectif du stage est de produire une première version du vocabulaire contrôlé d’ALiSEA via l’analyse du corpus avec KEOPS, ce vocabulaire contrôlé étant le socle du thésaurus documentaire. Le stage sera co-tutoré par le Cirad et le Gret, avec d’une part une Convention de stage établie entre le Gret et l’organisme de formation, et d’autre part, un accueil par le Cirad.

En préalable à la construction du vocabulaire contrôle, l’étudiant conduira une revue de la littérature sur les méthodes de construction de thésaurus et les thésaurus de l’agroécologie développés et comparera les résultats d’indexation et de classification de KEOPS sur le corpus d’Alisea avec les thématiques considérées par ASSET. Cette évaluation inclut l’adéquation du thésaurus Agrovoc pour des classifications terminologiques diverses (e.g. expertes vs profanes).

Profil du candidat :
Etudiant de Master 2 (informatique) ayant des compétences solides en gestion des connaissances et text mining sensibilisé à l’agroécologie.

Formation et compétences requises :
Master 2 (informatique) ayant des compétences solides en gestion des connaissances et text mining

Adresse d’emploi :
Cirad -UR AIDA
Avenue Agropolis
34032 Montpellier cedex 5
France

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Laboratoire/Entreprise : Laboratoire ERIC (Université Lyon 2, Campus Porte
Durée : 5 mois à partir de m
Contact : cecile.favre@univ-lyon2.fr
Date limite de publication : 2021-01-04

Contexte :
L’accès à l’informatique décisionnelle a été facilité par l’infonuagique. Toutefois, le décisionnel à la de-mande est soit limité, soit reste réservé aux spécialistes et hors d’atteinte des petites structures, indépen-dant.es et citoyen.nes, alors qu’il existe une forte demande sociétale d’analyse de données (self/open) simple et collaborative.
L’objectif du projet BI4people, financé par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR), est de rendre le décisionnel disponible en ligne à des utilisateur/trices disposant de peu de ressources financières et de connaissances techniques, en automatisant des processus actuellement au mieux semi-automatiques. Dans le cadre du projet BI4people (http://eric.univ-lyon2.fr/bi4people/), le laboratoire ERIC (Lyon 1/Lyon 2) recrute un∙e stagiaire pour une durée de 5 à 6 mois, afin de participer à la mise en œuvre des recherches prises en charge par ERIC sur la dimension d’analyse décisionnelle collaborative.

Sujet :
L’analyse collaborative dans le contexte de la Business Intelligence (BI) a été étudiée selon différents points de vues, mais reste rare et se concentre principalement sur des aspects techniques. Il n’existe pas de solution globale à ce jour.

Le stage comportera 2 volets :
– Définition d’une typologie des moyens collaboratifs pertinents pour l’analyse BI
– Conception / spécifications / implémentation d’un framework pour l’analyse collaborative qui s’inscrira dans le développement global du projet ANR

– Définition d’une typologie des moyens collaboratifs pertinents pour l’analyse BI
Cette tâche est importante pour obtenir à la fois une vue d’ensemble globale des méthodes de collabora-tion pertinentes pouvant être utilisées dans la BI et une idée précise de la manière dont les utilisa-teur/trices pourraient bénéficier de la collaboration. L’analyse collaborative comprend le partage d’analyse, le mashup, l’annotation, la comparaison, la publication…
– Conception / spécifications / implémentation d’un framework pour l’analyse collaborative qui s’inscrira dans le développement global du projet ANR
Le framework développé inclura la gamme de propositions déterminées dans la typologie précédente. Un schéma sera dessiné pour représenter le processus collaboratif envisagé. Des spécifications devront être proposées avant la mise en œuvre.

Profil du candidat :
Business Intelligence, programmation/programmation web, gestion de données, rigueur.

Formation et compétences requises :
Le sujet de stage s’adresse à des étudiant·es en 1re ou 2e année de master (ou équivalent) en informatique décisionnelle

Adresse d’emploi :
Candidature à adresser à cecile.favre@univ-lyon2.fr et sabine.loudcher@univ-lyon2.fr ayant pour objet « Candidature Stage collaboratif BI4people » d’ici le 22 décembre 2020, accompagnée d’un CV et d’une lettre de motivation, ainsi que vos notes de l’année universitaire précédente.
Les candidat∙es retenu∙es après examen des dossiers seront convoqué∙es pour un entretien en visioconférence en janvier

Document attaché : 202012041321_sujet-stage_BI4PEOPLE_collaboratif.pdf

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Laboratoire/Entreprise : LaBRI, Univ Bordeaux
Durée : 4-6 mois
Contact : loic.pauleve@lri.fr
Date limite de publication : 2021-01-04

Contexte :
L’apprentissage de modèles informatiques permettant de reproduire et prédire les processus de différenciation cellulaire est un défi majeur avec de nombreuses applications en biologie et en médecine. D’un côté, les modèles logiques, en particulier avec les réseaux booléens, sont de plus en plus employés par les équipes en biologie théorique et expérimentale car ils correspondent bien avec le niveau de granularité des connaissances actuelles. D’un autre côté, l’essor des technologies de mesures en cellule unique, en particulier avec le single-cell RNA-seq, offre des données précises sur l’évolution des expressions des gènes au cours de processus de différenciation cellulaire.
Actuellement, à l’aide de méthodes logiques, nous savons énumérer des réseaux booléens qui satisfont les pré-requis demandés sur leur comportement, mais nous ne savons pas encore comment sélectionner ceux qui ont de bonnes capacités prédictives.

Sujet :
L’objectif de ce stage est d’ouvrir la voie à l’apprentissage de réseaux booléens prédictifs, en mettant au point différents scores de prédiction et en appliquant des méthodes d’apprentissage pour mettre en avant des caractéristiques des réseaux à optimiser. Par exemple: vaut-il mieux privilégier les réseaux simples, ou au contraire les plus complexes?

Le travail consistera dans un premier temps à mettre au point différents scores de prédictions d’un réseau booléen vis-à-vis de données de tests, et de les appliquer à différents jeux de données relatifs à la différenciation cellulaire. Puis, il faudra explorer différentes méthodes de type “Random Forests” ou encore “Principal Feature Analysis” pour apprendre les caractéristiques des réseaux booléens qui influent leur score de prédiction.
Le résultat du stage sera intégré dans la bibliothèque Python BoNesis (github.com/bioasp/bonesis).

Profil du candidat :
Étudiant de master informatique ou bio-informatique, avec une spécialisation IA/machine learning

Formation et compétences requises :
Une bonne connaissance des méthodes de type “Random Forests” et “Principal Component Analysis” est requise.
Des connaissances générales en logique propositionnelle et SAT, et des compétences en programmation (Python préférable, mais pas nécessaire) sont recommandées.
Aucune connaissance particulière en biologie n’est nécessaire.

Adresse d’emploi :
LaBRI UMR CNRS 5800
351, cours de la Libération 33400 Talence
France

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Laboratoire/Entreprise : LIFAT, Université de Tours
Durée : 6 mois
Contact : cyril.derunz@univ-tours.fr
Date limite de publication : 2021-01-08

Contexte :
Financement pour 5 à 6 mois de stage à partir du 1er février pouvant être ajusté en fonction des contraintes du master.
Ce stage de Master 2, orienté Recherche, qui peut ouvrir sur une thèse, s’inscrit dans un projet de proposition d’un outil a destination des aveugles. Ce projet a pour but de développer des outils innovants basés sur des approches d’apprentissage profond pour l’aide aux déplacements des personnes malvoyantes.

Sujet :
Depuis quelques années, avec notamment l’avènement de l’apprentissage profond, l’IA fait des avancées importantes et son utilisation s’étend à de nombreux secteurs de l’activité humaine. Les jeunes handicapés sont soumis à un paradoxe : d’une part l’accès aux ressources numériques est une véritable révolution pour eux, mais d’autre part, ils sont souvent les laissés pour compte de ces progrès. Ce stage a pour mission de poser les jalons pour la production d’un assistant intelligent destiné à aider les handicapés visuels lors de leur déplacement.

Notre point de départ va concerner l’aide aux déplacements, avec trois volets liés entre eux. Une assistance intelligente doit permettre la reconnaissance d’objets dans l’environnement (objets du quotidien, objets personnels, objets mobiles, obstacles fixes, etc.), la cartographie de cet environnement pour adapter le déplacement à l’environnement direct, la définition d’interfaces homme-machine adéquates. Les objectifs de la thèse sur laquelle peut ouvrir ce stage portent sur trois thématiques de recherche en Informatique qui vont être liées entre elles par l’objectif que nous nous fixons : l’apprentissage machine à partir d’images, la géomatique, et l’interface homme/machine. Ce stage a pour objectif principal la question de l’apprentissage et de la reconnaissance des objets.

La détection d’objets à partir d’images/vidéos pour la reconnaissance de l’environnement proche a fortement bénéficié de l’avènement du Deep Learning allié aux évolutions récentes des capacités calculatoires [1,2]. Cependant, il reste de nombreux challenges pour l’instant non parfaitement couverts tels que la reconnaissance d’objets du quotidien, d’objets personnels, la détection d’obstacles fixes/mobiles, etc. Un aspect supplémentaire à la reconnaissance d’objets génériques concerne l’apprentissage en ligne et incrémental de la reconnaissance d’objet spécifiques choisis par la personne handicapée (comme ses objets personnels, l’entrée de son lycée, etc).

Une fois les objets détectés et reconnus, il faut pouvoir potentiellement les géolocalisés à l’aide des informations présentes dans les images et des données GPS du capteur exploité. Nous pourrions pour cela nous inspirer des travaux de [3,4] sur la localisation et l’identification des profondeurs.

L’objectif de ce stage est de proposer un premier outil permettant la reconnaissance d’objets à partir de photos en apprentissage profond et de leur localisation sur smartphone ANDROID. Après avoir fait un état de l’art sur les approches et outils existants, il s’agira donc de proposer un premier prototype.

Profil du candidat :
Etudiant en dernière année d’école d’ingénieur ou de master 2

Formation et compétences requises :
Etudiant en informatique.
Compétences attendues : Programmation Android, apprentissage (profond), notion de traitement d’images.

Adresse d’emploi :
LIFAT, Université de Tours, Site de Blois, 3 Place Jean-Jaurès 41000 BLOIS

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : DOING/– — –

Laboratoire/Entreprise : Université de Technologie de Troyes
Durée : 6 mois
Contact : babiga.birregah@utt.fr
Date limite de publication : 2021-01-10

Contexte :
DiTeX est une un laboratoire commun de R&D en Data-Innovation pour l’industrie du Textile et de l’habillement (DiTeX) qui regroupe l’Université de Technologie de Troyes (UTT) et l’Institut Français Textile et Habillement (IFTH). Il a pour ambition d’explorer les nouvelles voies dans le domaine de la modélisation statistique et des Big Data pour l’analyse et la valorisation des données appliquées aux problèmes et aux données de l’habillement. L’un des axes de développement de nouveau services concerne la segmentation des données métier (matériaux, mensurations, morphologie, etc.) pour permettre une exploration exhaustive des panels.

Sujet :
Pour avoir une bonne connaissance des données et de leur « richesse intrinsèque », il est important de mettre en place un moteur d’exploration. Ce moteur devra intégrer des algorithmes de classification et de segmentation de profils de campagnes de mensuration. L’objectif à terme est de pouvoir mesurer la fiabilité en identifiant (voir prédire) les critères impactant pour préconiser des techniques d’enrichissement de données.
Vos missions:
– Création d’une data pipeline
– Dimensionnement et création de la plateforme d’exploration
– Mise en place d’algorithmes de de segmentation
– Mise en place d’un outil de prédiction de la qualité des données.

Profil du candidat :
Le profil recherché doit avoir de bonnes connaissances en :
– Statistiques,
– Data science ou Big Data
– Ingénierie de la donnée (plus globalement),
De plus le candidat doit être en fin de cursus ingénieur ou master ou mastère spécialisé en Mathématiques ou Informatiques. Elle/il doit être capable de mener à bien une mission de « data exploration », présenter et défendre ses résultats.

Formation et compétences requises :
Sur le plan technique :
– Très bonne maîtrise de Python pour le data science,
– Rigueur dans la création et la gestion de bases de données,
– Connaissance en DataLake.

Adresse d’emploi :
Equipe Modélisation et Sûreté des Systèmes (M2S)
Département Recherche Opérationnelle, Statistiques Appliquées, Simulation (ROSAS)
Université de Technologie de Troyes
12, rue Marie Curie
CS 42060 – 10004 Troyes Cedex

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Laboratoire/Entreprise : PLEYO SAS / CNRS UMR6072 GREYC
Durée : Six months, e.g. Mar
Contact : riad.makdessi@pleyo.fr
Date limite de publication : 2021-01-15

Contexte :
The startup Pleyo, in development within Normandie incubation, works in the field of connected fitness. Its goal is to offer the user a complete experience by interacting in a playful way on a fitness device with a computer or game console.

Sujet :
The work required of the trainee is to design a training program generator. Depending on certain data, parameters and constraints, this generator will have to propose a training sequence made up of layers supporting multiple interacting training data and media formats, within the defined constraints.

A proposed approach for the work consists in the realization of a plan with techniques such as Markov decision process, and possibly machine learning techniques.

Profil du candidat :
Master 2 student in computer science or 3rd year of engineering school

Formation et compétences requises :
• Specialization in multi-agent systems, planning, reinforcement learning, MDP, constrained systems.
• Good level of English (read, written, spoken)
• Taste for sport, fitness, video games

Adresse d’emploi :
Caen (France)

Document attaché : 202101040906_PleyoInternshipProposal.pdf

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Laboratoire/Entreprise : ERIC
Durée : 6 mois
Contact : jerome.darmont@univ-lyon2.fr
Date limite de publication : 2021-01-15

Contexte :
Ce stage se fera dans le cadre du projet ANR BI4people (http://eric.univ-lyon2.fr/bi4people/). L’utilisation des technologies de la Business Intelligence (BI) telles que les entrepôts de données et les techniques d’analyses en ligne (OLAP) restent complexes et restent réservées à des spécialistes. L’objet de ce projet est de simplifier ces outils afin de les rendre accessible au plus grand nombre, par exemple des petites entreprises, des associations, etc.
Dans ce contexte, il est important de permettre aux utilisateurs de pouvoir partager leurs données et leurs analyses. Ces aspects collaboratifs induisent des problèmes de confidentialité de données. Plus généralement, on peut considérer des scenarios où la confidentialité des données et/ou des requêtes doivent être garanties. On pourrait également imaginer que des utilisateurs agissent de manière malveillante afin d’altérer les calculs afin de compromettre le résultat des requêtes.

Sujet :
Quelques solutions sont proposées dans la littérature [1, 2]. Les plus abouties en termes de sécurité sont basées sur des primitives cryptographiques récentes, appelées FHE (Fully Homomorphic Encryption). Ces solutions n’ont à ce jour qu’un intérêt théorique puisque les FHE existants ne sont pas encore suffisamment performants [3]. Pour obtenir des solutions utilisables en pratique, il est donc nécessaire de rogner sur la sécurité et/ou sur le type de requêtes pris en charge. Des hypothèses sur les utilisateurs peuvent aussi être introduites, comme par exemple la proportion d’utilisateurs malveillants, le fait qu’ils soient coalisés ou non, etc.
L’objectif de ce stage est d’explorer, d’évaluer et de comparer les solutions existantes. Suite à cette analyse de l’état de l’art, il s’agira de proposer des solutions dédiées à la problématique et aux contraintes spécifiques du projet BI4people.

[1] Raluca A. Popa, Catherine M. S. Redfield, Nickolai Zeldovich, Hari Balakrishnan: CryptDB: protecting confidentiality with encrypted query processing. SOSP 2011: 85-100
[2] Dan Boneh, Craig Gentry, Shai Halevi, Frank Wang, David J. Wu: Private Database Queries Using Somewhat Homomorphic Encryption. ACNS 2013: 102-118
[3] Ilaria Chillotti, Nicolas Gama, Mariya Georgieva, Malika Izabachène:TFHE: Fast Fully Homomorphic Encryption Over the Torus. J. Cryptol. 33(1): 34-91 (2020)

Profil du candidat :
Compétences avancées (niveau M2) en informatique. Notions de cryptographie et/ou de sécurité informatique fortement souhaitées.

Formation et compétences requises :
Compétences avancées (niveau M2) en informatique. Notions de cryptographie et/ou de sécurité informatique fortement souhaitées.

Adresse d’emploi :
Merci d’adresser, avant le 15 décembre 2020, votre candidature avec un CV, une lettre de motivation ainsi que vos notes de l’année universitaire en cours et de l’année dernière à gerald.gavin@univ-lyon1.fr  et jerome.darmont@univ-lyon2.fr

Document attaché : 202011241344_StageBI4people4.pdf

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Laboratoire/Entreprise : MIA (AgroParisTech) et ICube (Université de Strasb
Durée : 5 à 6 mois
Contact : gancarski@unistra.fr
Date limite de publication : 2021-01-29

Contexte :
Ce stage de Master 2, très fortement orienté Recherche, s’inscrit dans le cadre d’un projet co-porté par les laboratoires MIA (AgroParisTech) et ICube (Université de Strasbourg) en collaboration étroite avec le CNES (Centre National d’Études Spatiales). Ce projet a pour but de développer des méthodes innovantes en apprentissage automatique pour l’étude et l’interprétation de séries d’images de télédétection en vue d’extraire et mettre en évidence les phénomènes sous-jacents affectant les zones étudiées (urbanisation, occupation des sols, pratiques agricoles, érosion…). Il s’agit d’un problème difficile pour lequel des algorithmes peuvent s’appuyer sur des données variées, dont certaines, assez peu nombreuses, ont été étiquetées par des experts, et d’autres, beaucoup plus nombreuses, ne l’ont pas été.

Sujet :
L’objectif de ce stage est d’étudier les concepts entrant dans la définition de méthodes d’apprentissage collaboratif multi-paradigme pour des données temporelles dans lesquelles des agents d’apprentissage supervisé et des agents d’apprentissage non supervisé collaborent afin d’améliorer mutuellement leur résultat et, in fine, de parvenir à une interprétation consensuelle de ces données.}

Il s’agira en particulier de répondre des questionnements scientifiques tels que :
– Quelles informations (données, hypothèses, contraintes…) les méthodes doivent elles échanger pour mettre en place cette collaboration ?
– Comment évaluer globalement ou deux à deux des résultats par nature différent (modèle vs regroupement par exemple) ?
– Comment en déduire globalement ou au niveau des agents, les actions à entreprendre pour améliorer les résultats et/ou consensus courants?
– Comment combiner les avis des différents agents en un consensus ?
– Dans un scénario d’échanges itératifs, comment assurer une convergence ?

La littérature propose déjà un certain nombre des réponses plus ou moins partielles pour des apprentissages particuliers sur lesquelles le travail de stage pourra s’appuyer. En apprentissage supervisé, on citera les méthodes d’ensemble (e.g. boosting,co-learning…) ou les approches semi-supervisées . Par contre, hormis la méthodeSamarah proposée par ICube, très peu de résultats sont établis dans le cadre de méthodes essentiellement non supervisées, en particulier dans le cas du clustering collaboratif. Mais, ces cadres sont tous très contraints et ne s’étendent pas directement à l’étude de l’apprentissage collaboratif multi-paradigme avec des données hétérogènes mesurées dans le temps.

Profil du candidat :
Master 2 en Informatique ou équivalent en École d’ingénieur

Avoir une appétence forte pour le recherche en informatique et dans le domaine de la télédétection
Être curieux et autonome, tout en ayant le goût du travail en équipe

La volonté de poursuivre en thèse sera un plus indéniable. Une thèse est d’ores et déjà finançable. Ce stage sera donc un bon tremplin …

Formation et compétences requises :
Avoir de solides connaissances en apprentissage automatique.
Avoir de bonnes notions d’analyse de séries temporelles
Etre à l’aise dans l’écriture de programmes Python et/ou en JAVA

Une connaissance en analyse d’images de télédétection est un plus mais n’est pas obligatoire, une formation à l’analyse de ce type de données sera assurée.

Adresse d’emploi :
Le stagiaire pourra choisir le lieu de déroulement de stage entre :
– UMR MIA (Mathématiques et Informatique Appliquées) 16, rue Claude Bernard, 75005 Paris
et
– UMR ICUBE – Université de Strasbourg , 300 bld Sébastien Brant, 6412 Illkirch

Document attaché : 202012011403_Sujet-M2-CNES.pdf

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Laboratoire/Entreprise : Mercator-Ocean et IMT-Atlantique
Durée : 6 mois
Contact : carlos.granero-belinchon@imt-atlantique.fr
Date limite de publication : 2021-01-29

Contexte :
Mercator Océan, centre européen de prévision océanique, décrit et prévoit l’évolution de l’océan en développant, et en maintenant en condition opérationnelle, plusieurs modèles numériques d’analyse et de prévision océanique.

Grâce aux champs de courants produits par ces modèles, il est possible de simuler les trajectoires de différents objets qui dérivent dans les océans, en surface ou en profondeur : icebergs, débris plastiques, nappes de pétrole, organismes marins dérivant passivement (plancton) ou plus activement (animaux marins se déplaçant avec les courants plus leur vitesse de nage).

On sait cependant que, même pour les objets les plus simples, à savoir les bouées dérivantes spécifiquement conçues pour suivre les courants, les trajectoires simulées et observées se comparent souvent assez mal (statistiquement) : les déplacements et leur variabilité sont souvent mal estimées.

Sujet :
L’objectif du stage proposé est de développer et mettre en oeuvre un outil de simulation de trajectoires basé sur des techniques de l’intelligence artificielle, et plus particulièrement d’apprentissage profond. Les variables explicatives utilisées seront choisies parmi l’ensemble des variables simulées par les modèles océaniques, à commencer par les courants. On exploitera, non seulement les valeurs de courants le long des trajectoires, mais également dans leur voisinage (spatial et temporel).

Dans un premier temps on s’attachera à développer un outil capable de simuler les trajectoires de bouées dérivantes simples. Le jeu de données d’apprentissage disponible pour ce faire est énorme : depuis 2003, entre 600 et 1600 bouées sont suivies quotidiennement sur l’ensemble des océans du globe ([1], et https://www.aoml.noaa.gov/global-drifter-program/ ). En fonction des progrès réalisés, on pourra dans un second temps, s’attaquer à la simulation de trajectoires plus complexes comme celles de tortues marines (aussi suivies par satellite). Les tortues, comme les
flotteurs, dérivent avec le courant et nagent pour se maintenir dans des eaux riches en nourriture et suffisamment chaudes. On devrait donc pouvoir simuler leurs trajectoires en utilisant, comme variables explicatives, la vitesse du courant, la température de l’eau et la production primaire ou la concentration en micro-necton (un proxy de la densité de proies). L’objectif ultime de ce type de recherche est de prévoir les zones où les tortues marines sont
les plus susceptibles de se concentrer afin de pouvoir prendre des mesures adéquates pour minimiser les risques de captures accidentelles par les flottes de pêches industrielles.

D’un point de vue méthodologique, on explorera des approches de type GAN (Generative Adversarial Network) pour la simulation conditionnelle de trajectoires [2]. Après une phase d’état de l’art, un part importante du travail envisagé consistera à explorer et évaluer différents types de représentation et modélisation des données trajectométriques intégrant pleinement leur caractère stochastique (e.g., représentation latente, équations différentielles stochastiques, formulations variationnelles,…) [3,4,5]. Un autre aspect important portera sur la mise en oeuvre d’un cadre expérimental d’évaluation quantitatif et qualitatif des modèles et algorithmes proposés pour les différents cas d’étude envisagés.

Profil du candidat :
Formation initiale de type Master 2/Ingénieur en Mathématiques Appliquées, Sciences des données, Intelligence Artificielle et/ou Traitement du Signal

Formation et compétences requises :
Bases en apprentissage statistique et réseaux de neurones

Intérêt pour les problèmes environnementaux.

Grande rigueur dans l’organisation du travail, la gestion des données et des résultats. Les données à manipuler sont diverses et représentent des volumes importants.

Bonne maîtrise de l’outil informatique : ce stage nécessite la connaissance de l’environnement LINUX, et du langage de programmation Python.

Connaissances appréciées des environnements Python pour l’apprentissage profond (keras, tensorflow et/ou pytorch)

Adresse d’emploi :
Le stage sera co-encadré par Carlos Granero-Belinchon (IMT Atlantique), Simon van Gennip et Philippe Gaspar (Mercator Océan). Les étudiants intéressés sont invités à envoyer leur CV
et une lettre de motivation à carlos.granero-belinchon@imt-atlantique.fr , pgaspar@mercator-ocean.fr et svangennip@mercator-ocean.fr

En fonction des conditions sanitaires du moment, le stage pourra se dérouler à Ramonville Saint-Agne (Toulouse) sur le site de Mercator-Océan, à l’IMT Atlantique ou en télétravail.

Document attaché : 202011090713_PropositionStage_IA et trajectoires_v2.pdf

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : LIRIS CNRS UMR 5205 (Villeurbanne, France)
Durée : 5/6 mois
Contact : hamida.seba@univ-lyon1.fr
Date limite de publication : 2021-01-29

Contexte :
Ce stage sera encadré par Mohammed Haddad (LIRIS, Lyon 1) Hamida Seba (LIRIS, Lyon 1) en collaboration avec des collègues de l’université du Luxembourg. Il s’effectuera dans le cadre du projet ANR PRCI GLADIS et peut donner lieu à une continuation en thèse.

Sujet :
Le sujet détaillé est disponible sur ce lien: https://perso.liris.cnrs.fr/hamida.seba/Master/StageM2_Gladis.pdf

Profil du candidat :
M2 informatique

Formation et compétences requises :
La maitrise de C++ et python est appréciée

Adresse d’emploi :
LIRIS, université Lyon 1
43, bd du 11 novembre 1918
Villeurbanne

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : LISIC
Durée : 6 mois
Contact : matthieu.puigt@univ-littoral.fr
Date limite de publication : 2021-01-29

Contexte :
Ce stage s’inscrit dans le cadre des activités conjointes des laboratoires LISIC (EA 4491, Calais) – plus particulièrement les activités de l’équipe SPeciFI dans l’antenne de Saint-Omer du LISIC — et LOG (UMR 8187, Wimereux) – plus particulièrement les activités de l’équipe TELHYD du LOG – autour de l’imagerie satellitaire pour l’observation marine côtière, dans le cadre de la Structure Fédérative de Recherche “Campus de la Mer” et du projet TOSCA OSYNICO financé par le CNES. En particulier, dans le cadre de ces projets initiés en 2020, le LISIC développe des méthodes à la frontière entre traitement du signal et des images et intelligence artificielle appliquées aux données satellitaires (images multi- ou hyper-spectrales). Le LOG s’intéresse à l’analyse théorique et l’observation de processus physiques afin de comprendre et prévoir leurs impacts sur l’environnement marin, d’un point de vue de la biologie ou de la biogéochimie.

Sujet :
L’observation satellitaire de notre planète connaît depuis plusieurs décennies d’importantes avancées instrumentales, avec des développements conséquents que ce soit en terme de résolution spatiale (par exemple en télédétection de la couleur de l’eau à haute résolution spatiale 10-60 m) et en terme de résolution spectrale (imagerie hyper-spectrale). Une image Multi-Spectrale (MS) ou Hyper-Spectrale (HS) consiste en un cube de données dont deux axes décrivent les variations spatiales et un axe décrit les variations spectrales. La principale différence entre une image HS et une image MS réside dans le nombre très réduit de bandes spectrales observées dans cette dernière.

Cependant, le Rapport Signal à Bruit (RSB) d’un imageur MS ou HS est proportionnel au rapport entre la surface du capteur et le nombre de bandes spectrales observées. En conséquence, pour maintenir un RSB constant, l’augmentation du nombre de bandes spectrales dans une image HS entraîne une diminution de la résolution spatiale. Ainsi, aujourd’hui, notre planète est observée à la fois par des imageurs MS ayant une très bonne résolution spatiale mais une faible résolution spectrale et par des imageurs HS ayant une très bonne résolution spectrale mais une faible résolution spatiale (et un ensemble d’imageurs aux propriétés intermédiaires).

La fusion d’images satellitaires MS et HS permet d’améliorer les résolutions spectrale, spatiale voire temporelle de ces images d’origine. De nouvelles techniques de fusion d’images émergent constamment, faisant passer de pan-sharpening (fusion d’images panchromatiques et multi-spectrales) à la fusion spectro-spatio-temporelle de données provenant de différents capteurs et plates-formes. Cependant, l’application de la fusion d’images satellitaires dans le domaine de l’observation des environnements marins et des zones côtières reste encore limitée. Le nombre et la complexité des différentes techniques disponibles aujourd’hui peuvent être accablants, empêchant ainsi les utilisateurs d’exploiter pleinement le potentiel des produits de fusion spectro-spatio-temporelle des images tels que la fusion des images provenant de Sentinel-3 et Sentinel-2. Ainsi, plusieurs techniques de fusion de données (aussi connues sous le nom de multi-sharpening) ont été proposées ces dernières années pour créer de nouvelles images combinant la bonne résolution spatiale des image MS avec la bonne résolution spectrale des images HS [1]. Les principales techniques modernes de fusion sont basées sur des décompositions matricielles [2] ou tensorielles [3], ou sur de l’apprentissage profond [4].

Dans le cadre de ce stage, nous nous intéressons à l’observation marine côtière via les données des satellites Sentinel-2 et Sentinel-3. Les images obtenues par ces deux satellites permettent d’étudier la couleur de l’océan, c’est-à-dire la répartition spatiale et temporelle de la concentration en phytoplancton, en matière en suspension et en matière organique. Les données Sentinel-2 consistent en des cubes avec 13 bandes spectrales pour une résolution spatiale variant de 10 à 60 m en fonction des bandes, acquises tous les 5 jours environ. Les données Sentinel-3 sont des cubes avec 21 bandes spectrales pour une résolution spatiale de 300 m, acquises tous les jours. En observation marine, pour comprendre les phénomènes complexes qui se passent en milieu côtier, il est nécessaire que les données à disposition combinent :
– une bonne résolution spectrale pour mieux analyser le milieu biogéochimique (chlorophylle, particules en suspension, etc) ;
– une bonne résolution spatiale pour mieux appréhender les phénomènes de répartition de ce milieu qui sont beaucoup plus complexes en milieu côtier qu’en pleine mer ;
– une courte période d’acquisition de ces images pour repérer des phénomènes très concentrés dans le temps (blooms de phytoplanctons par exemple).
Aucune donnée satellitaire ne permet aujourd’hui de respecter ces trois contraintes.

Dans le cadre de ce stage, nous proposons de traiter conjointement les séries temporelles de données Sentinel-2 et Sentinel-3, afin de générer une nouvelle série temporelle de cubes de données obtenues par multi-sharpening, permettant d’obtenir des images avec le nombre de bandes spectrales de Sentinel-3 et la résolution spatiale de Sentinel-2. Cela permettra de mieux caractériser la couleur des eaux côtières. Les méthodes envisagées feront soit appel à un formalisme régularisé de factorisation matricielle (démélange ou séparation de sources) soit à un formalise de type apprentissage profond.

Le stage pourra être poursuivi par la préparation d’une thèse dans le domaine de la factorisation matricielle et/ou de l’apprentissage profond (sous réserve d’obtention d’un financement : ce point sera défini durant le stage).

Reférences :
[1] Laetitia Loncan, Luis B De Almeida, Jos ́e M Bioucas-Dias, Xavier Briottet, Jocelyn Chanussot, NicolasDobigeon, Sophie Fabre, Wenzhi Liao, Giorgio A Licciardi, Miguel Simoes, et al. Hyperspectral pansharpening :A review.IEEE Geoscience and remote sensing magazine, 3(3) :27–46, 2015.
[2] Naoto Yokoya, Takehisa Yairi, and Akira Iwasaki. Coupled nonnegative matrix factorization unmixing for hy-perspectral and multispectral data fusion. IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing, 50(2) :528–537, 2011.
[3] Charilaos I Kanatsoulis, Xiao Fu, Nicholas D Sidiropoulos, and Wing-Kin Ma. Hyperspectral super-resolution :A coupled tensor factorization approach. IEEE Transactions on Signal Processing, 66(24) :6503–6517, 2018.
[4] Renwei Dian, Shutao Li, Anjing Guo, and Leyuan Fang. Deep hyperspectral image sharpening. IEEE transactions on neural networks and learning systems, (99) :1–11, 2018.

Profil du candidat :
Vous préparez actuellement un Master 2 ou un diplôme d’ingénieurs en Sciences de Données : traitement du signal et des images, informatique avec une dominante en intelligence artificielle/apprentissage/machine learning, mathématiques appliquées, etc.

Formation et compétences requises :
Vous préparez actuellement un Master 2 ou un diplôme d’ingénieur en sciences de données (traitement du signal et des images, informatique avec une dominante en intelligence artificielle/apprentissage/machine learning, mathématiques appliquées). Vous êtes curieux(se) et très à l’aise en programmation (Matlab, Python). Vous lisez et parlez avec aisance l’anglais courant. Bien que non-obligatoire, une première expérience en factorisation de données (matrices ou tenseurs, séparation de sources, apprentissage de dictionnaire) ou en deep learning sera appréciée.

Pour candidater, merci d’envoyer un courriel à {ahed.alboody, matthieu.puigt, gilles.roussel} [at] univ-littoral.fr en y annexant les documents pouvant supporter votre candidature :
– votre CV,
– une lettre de motivation,
– vos relevés de notes de Licence 3, Master 1, Master 2 (si ces dernières sont disponibles) ou d’Ecole d’Ingénieurs (première à troisième année),
– deux lettres de recommandation ou les noms et moyens de contact de deux référents académiques.

Adresse d’emploi :
Le stage aura lieu dans la nouvelle antenne de Longuenesse du LISIC, dédiée actuellement à l’imagerie hyperspectrale. Cette antenne, créée récemment, compte à ce jour 5 chercheurs permanents, 1 chercheur post-doctorant et 4 doctorants. Les encadrants du LISIC apporteront apporteront leur expertise respective en traitement des images MS/HS et en machine learning (deep learning, factorisation matricielle, optimisation) pour l’imagerie satellitaire.

De nombreux échanges auront lieu avec le LOG, situé à Wimereux. Le LOG apportera ses compétences sur la couleur de l’océan, notamment sur l’analyse des images fusionnées et leur validation. Le LOG fournira les mesures in-situ de validation et des images dans des zones côtières d’intérêt (Manche orientale, Guyane, Cambodge, Vietnam).

Ces deux laboratoires sont situés au coeur du Parc naturel régional des caps et marais d’Opale, à proximité directe de Lille, de l’Angleterre, de la Belgique et de l’Europe du Nord (Amsterdam à 4h de route de Longuenesse).

Document attaché : 202011131738_Stage_LISIC_SFR_2021.pdf

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : MACLEAN/– — –

Laboratoire/Entreprise : UMR TETIS
Durée : 6 mois
Contact : raffaele.gaetano@cirad.fr
Date limite de publication : 2021-01-30

Contexte :
Le suivi de l’état des forêts tropicales est d’importance mondiale (Herold et al. 2019). Il appelle le suivi dans la durée et sur de grandes surfaces de variables « biophysiques » de structures forestières (couvert, hauteur de canopée, biomasse épigée, …) et d’indicateurs de diversité spécifique et fonctionnelle. Le suivi du couvert arboré, notion polysémique, a fait l’objet de travaux importants, principalement basés sur les séries d’images satellitaires longues à moyenne résolution ou haute résolution spatiale (MODIS, Landsat, respectivement), Ceci a débouché sur des produits cartographiques ambitieux à des échelles pantropicales et mondiales (e.g. Avitabile et al. 2012; Hansen et al. 2013 ; Kubayashi et al. 2016). Cependant, ces produits recèlent des faiblesses de plusieurs ordres. Si celles-ci n’opèrent pas leur intérêt, tant que l’ampleur des surfaces peut permettre la compensation des imprécisions locales, elles rendent leurs utilisations hasardeuses pour des applications demandant de se focaliser sur des surfaces plus restreintes (downscaling), ou requérant un niveau de précision supérieur à celui effectif (qui n’est pas toujours explicite, d’ailleurs).

Le projet Sé2coul, a pour objectif de traduire les opportunités, offertes par les données Sentinel-1 et Sentinel-2, pour le suivi et la caractérisation des forêts, en tirant partie : i) De la densification temporelle des séries temporelles d’images satellitaires et de leur accroissement en résolution spatiale. Ceci doit permettre d’aller bien au-delà de ce qui peut déjà être fait actuellement avec les séries HR de type « Landsat » (par exemple via le Google Earth Engine) pour corriger les effets instrumentaux dans l’optique de détection de changements francs de couvert (déforestation, feu, plantation, …), ou de détections de perturbations localisées (exploitation, chute d’arbres, …). ii) La facilitation de l’usage conjoint des données radar et optiques (Sentinel-1 et -2). En complément de l’optique, l’information radar en bande C (bien que probablement saturante à des niveaux assez bas de couvert et de biomasse) est sensible à la structure tridimensionnelle, et peut aider à lever des ambiguïtés dans les végétations complexes, ouvertes (par exemple pour le suivi de la dynamique des trouées, naturelles ou non), ou marquées par des variations saisonnières d’humidité (y compris du substrat). iii) Le développement de techniques d’intelligence artificielle (deep-learning) pour tirer parti des atouts des données Sentinel dans la perspective spécifique de la caractérisation biophysique des composantes ligneuses de la végétation dans des contextes tropicaux variés. Il est envisagé dans l’esprit de TWINNS (TWIn Neural Networks for Sentinel data ; Ienco et al. 2019).

Le projet aura pour objectif de traduire ces opportunités en avancées significatives concernant l’estimation de caractéristiques fondamentales de la végétation ligneuse : (i) structure : Hauteur de canopée, LAI, biomasse épigée, (ii) diversité, (iii) signature fonctionnelle saisonnière.

Sujet :
En s’appuyant sur des méthodes d’apprentissage profond, l’objectif de ce stage est d’évaluer le potentiel de tels méthodes pour la cartographie et la caractérisation des typologies de couvert forestier à l’aide d’imagerie multi-source Sentinel-1 et Sentinel-2 sur des terrains d’étude telles que la Guyane, le Cameroun et le Sénégal. Un ou deux terrains d’études, parmi ceux listés par avant, seront choisis en accord avec les chercheurs partenaires du projet (UMR AMAP).
Pour cela, nous allons nous appuyer sur des séries temporelles d’images satellitaires radar/optique pour mieux reconnaître les différentes typologies de couvert forestier. Afin de l’évaluation, la méthode d’apprentissage profond sera aussi comparée à des méthodes plus classiques et communément utilisées en télédétection (par exemple Random Forest ou SVM). Un deuxième objectifs, si le temps le permettra, sera dédié à l’utilisation de techniques déjà disponibles au sein de l’UMR TETIS pour évaluer le potentiel des données radar/optique (Sentinel-1 et Sentinel-2) pour l’estimation de variables biophysiques (i.e. LAI ou autre) toujours à travers des méthodes d’apprentissage profond.

Les principales étapes envisagées pour la réalisation du stage sont :
+ Analyse bibliographique sur les méthodes d’apprentissage profond pour le couplage radar/optique pour la cartographie automatique.
+ Mise en place du jeu de données :
+ Prise en main des données existantes
+ Téléchargement des série temporelle d’images Sentinel-1 et Sentinel-2
+ Prétraitement des données satellitaires
+ Préparation du jeu de données pour l’évaluation
+ Identification d’une méthode d’apprentissage profond déjà existante.
+ Mise en place de telle méthode dans le contexte de la cartographie de la typologie du couvert forestier
+ Évaluation de la méthode déployée à travers une analyse quantitative ainsi qu’ une analyse qualitative.
+ Rédaction du rapport et préparation de la soutenance.

Profil du candidat :
– Master II ou dernière année d’école ingénieur en Traitement du Signal, Informatique ou Télédétection,

– Compétences :
+ programmation informatique et géomatique
+ Bonne connaissance des méthodes de machine learning et deep
learning
+ Goût pour la recherche scientifique et l’interdisciplinarité
+ Maîtrise de l’anglais et bonne capacité rédactionnelle

Formation et compétences requises :
– Master II ou dernière année d’école ingénieur en Traitement du Signal, Informatique ou Télédétection,

– Compétences :
+ programmation informatique et géomatique
+ Bonne connaissance des méthodes de machine learning et deep
learning
+ Goût pour la recherche scientifique et l’interdisciplinarité
+ Maîtrise de l’anglais et bonne capacité rédactionnelle

Adresse d’emploi :
Maison de la Télédétection, 500, rue Jean François Breton – Montpellier (34)

Document attaché : 202012141346_Stage_Sen2Coul.pdf

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : LISN
Durée : 5 mois
Contact : anne-laure.ligozat@universite-paris-saclay.fr
Date limite de publication : 2021-01-30

Contexte :
De nombreux travaux en Traitement Automatique de la Langue (TAL) s’appuient sur des méthodes d’apprentissage. Ainsi, l’apprentissage profond offre des performances souvent intéressantes pour de nombreuses tâches d’analyse de textes. L’essor récent des méthodes neuronales donne lieu à une utilisation croissante de ressources numériques pour un large éventail de problèmes. Dans ce contexte, les méthodes symboliques ou méthodes d’apprentissage “classiques” sont délaissées alors qu’une comparaison systématique serait intéressante du point de vue scientifique, opérationnel et environnemental. En particulier, les méthodes neuronales ont un impact environnemental élevé qui ne cesse d’augmenter avec les années (Schwartz et al., 2019). Un exemple de travail pertinent en traitement automatique des langues est (Strubell et al., 2019), qui a étudié la consommation énergétique de l’apprentissage de plusieurs modèles. (Schwartz et al., 2019) prône donc l’émergence de travaux de Green AI, en parallèle de travaux standards, dans lesquels l’efficience des méthodes serait mise en valeur, c’est-à-dire la capacité à obtenir une performance avec un minimum de ressources.

Sujet :
Ce projet a pour objectif à long terme de proposer une comparaison détaillée de l’utilisation d’un large panel de méthodes de traitement automatique de la langue du point de vue de leur performance, de leur complexité algorithmique, du temps humain et machine requis pour les mettre en oeuvre.
Dans un premier temps, il s’agira de réaliser une revue systématique des outils de mesure de l’impact environnemental des expériences informatiques. Une veille de la littérature récente montre que divers outils existent afin d’estimer l’impact des expériences informatiques. On recense notamment des outils en ligne comme par exemple, Green Algorithms (http://www.green-algorithms.org/) et ML CO2 impact (https://mlco2.github.io/impact/) ou des outils à intégrer dans la mise en oeuvre des expériences, par exemple, “experiment impact tracker” (Henderson et al., 2020) et “carbon tracker” (Anthony et al., 2020). Nous souhaitons recenser systématiquement les outils existant et les étudier afin de déterminer les mesures d’impact calculées, la facilité de mise en oeuvre, la portée d’utilisation possible.

Profil du candidat :
M2 ou école d’ingénieur en fin d’études, avec spécialisation en informatique

Formation et compétences requises :
Le.a stagiaire devra avoir de bonnes compétences en informatique. Des connaissances en traitement automatique de la langue seront particulièrement appréciées. Le contenu et l’ambition du stage pourront être modulés en fonction du niveau d’étude et de la durée du stage du/de la candidat.e.

Adresse d’emploi :
rue du Belvédère, Orsay

Document attaché : 202012011258_StageM2_GreenNLP2020_FR.pdf

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : UMR AGAP, CIRAD
Durée : 6 mois
Contact : frederic.boudon@cirad.fr
Date limite de publication : 2021-01-30

Contexte :
Dans un contexte de changement climatique et de diminution des intrants (engrais, eau, pesticides, etc.), la sélection de variété d’arbres fruitiers performants en condition de culture sub-optimale devient incontournable. Des traits architecturaux (structure de la plante, distribution du feuillage) doivent être considérés pour prendre en compte le potentiel de production intrinsèque des variétés (génotypes), leurs interactions avec l’environnement (lumière, pluie, insectes, etc.) et leur facilité de conduite. Pour évaluer de tels traits de manière précise et à haut débit, nous développons une approche basée sur les LiDARs aéroportés qui permettent de scanner rapidement un verger en 3D. Ce choix fait suite à des premières expérimentations qui ont consisté à scanner en période de production (avec feuilles et fruits) les arbres d’une collection de variétés de pommiers, par LiDAR terrestres. Ces approches se sont révélées fastidieuses dans le processus d’acquisition. Elles nous ont toutefois permis une première caractérisation de l’architecture des arbres (Coupel et al., 2019) et une estimation de leur production (Artzet et al., 2020). Une partie de ces méthodes est basée sur des approches de machine et deep learning, avec notamment l’utilisation de réseaux pour le traitement de points, tel que RandLa-Net (Hu et al., 2019). Récemment, nous avons souhaité revisiter la méthode d’acquisition en procédant à des scans par Lidar aéroporté, plus rapides. Néanmoins les résolutions et les points de vue différents entre LiDAR terrestre et aéroporté nécessitent d’adapter les méthodes de caractérisation et d’identification des organes. Dans le cadre de scans de vergers entiers, l’identification des arbres individuels et des points leur correspondants est un challenge important pour l’automatisation de nos méthodes.

Sujet :
L’objectif de ce stage est donc de formaliser un pipeline de traitement de points basé sur des méthodes de machine et deep learning qui permettra d’identifier chaque instance d’arbre, de caractériser sa forme, sa densité foliaire et sa production en adaptant des indicateurs et les méthodes d’estimation associé à ces nouvelles données. L’enjeu méthodologique est d’adapter à des résolutions variées, possiblement très faibles, des méthodes de détection d’instances (instance segmentation) tel que RandLa-Net. Pour cela des bases de données synthétiques et réelles à différentes résolutions pourront être combinées pour l’apprentissage. Les sorties de ce pipeline seront des indicateurs quantitatifs et objectifs du développement des arbres pouvant entrer dans des analyses génétiques de type Genome Wide Association Studies (GWAS).

Étapes principales du stage :
• Etat de l’art, bibliographie (méthodes de deep et machine learning, applications open-source, librairies python, …)
• Prise en main de la chaine de traitement existante et test sur les nouveaux jeux de données
• Développement et paramétrisation d’algorithmes adaptés pour l’identification des arbres et des organes.
• Test de la nouvelle chaine de traitement pour la caractérisation de la variabilité génotypique de la population

Profil du candidat :
– Informaticien(ne) motivé(e) et curieux(se).
– Bonne connaissance du Python et/ou C++.
– Connaissance en deep learning.
– Goût pour la modélisation 3D des plantes.
– Aptitude à travailler en équipe.
– Autonome (possible situation de télétravail).

Formation et compétences requises :
Ce stage peut convenir à des étudiant(e)s d’école d’ingénieur ou en informatique, ayant reçu des enseignements sur les méthodes de machine et deep learning.
Une compétence en programmation sera nécessaire, ainsi qu’une capacité rédactionnelle et le goût pour le travail multidisciplinaire.
Une première expérience (stage, TP) en machine et deep learning serait un plus.

Adresse d’emploi :
Avenue d’Agropolis, TA 178/04, 34398 Montpellier.

Document attaché : 202012030951_stage_DigitAG_AGAP-AFEF-vf.pdf

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : UMR AGAP, CIRAD
Durée : 6 mois
Contact : frederic.boudon@cirad.fr
Date limite de publication : 2021-01-30

Contexte :
Pour satisfaire les demandes sociétales pour une agriculture plus durable et écologique, des modèles de plantes simulant leurs croissances et leurs fonctionnements (FSPM) sont développés par la communauté scientifique. Dans le cadre de la plateforme de modélisation OpenAlea, nous développons depuis plusieurs années, différents formalismes de simulation (Pradal et al., 2008; Boudon et al., 2012). En particulier, des grammaires formelles, i.e. L-systems, permettant la réécriture efficace d’arborescences ou des méthodes de réécriture de graphes multi-échelles (MTG) sont disponibles et ont permis de modéliser une grande variété de plantes (pommier, manguier, palmier, maïs, sorgho, etc.).
Les modèles FSPM sont un outil pour l’étude et l’analyse des interactions plante-plante dans des couverts complexes en association (Gaudio et al., 2019, Braghiere et al., 2020). Ils permettent de simuler en 3D la compétition aérienne et racinaire pour l’acquisition des ressources (lumière, nutriments) de façon mécaniste. Il est cependant nécessaire de simuler, à l’échelle de l’organe et en 3D, le développement et le fonctionnement d’un grand nombre de plantes en interaction au sein d’un même couvert. Pour faire cela dans des temps raisonnables, il serait nécessaire de distribuer les calculs de simulation sur de grandes infrastructures de calcul (cluster, cloud). Or, actuellement, il n’existe pas ni de formalisme ni de technologie permettant de distribuer automatiquement la simulation 3D de plantes hétérogènes en interaction.

Sujet :
Le challenge auquel nous essayons de répondre est donc de simuler efficacement un ensemble de plantes en interaction spatiale (compétition pour l’acquisition des ressources) et temporelle (rétroaction entre la structure et la fonction). L’objectif de ce stage est d’analyser différentes stratégies de parallélisation pour simuler en 3D la croissance et le fonctionnement de plantes et peuplements sur des architectures à mémoire partagée et en environnement distribué (Pradal et al., 2017; Heidsieck et al., 2020). Un des enjeux est de définir des design patterns pour des calculs distribués à différentes granularités (simulation parallèle d’une plante isolée, calcul distribué d’un grand nombre de plantes en interaction) en utilisant les technologies actuelles (OpenMP, Spark, Dask). Un enjeu important est de prendre en compte les dépendances entre les calculs faits sur les structures lors de leurs réécritures en fonction des stratégies utilisées (en place ou par copie).
Une application de ce travail sera la simulation d’un système agroforestier mélangeant palmiers et riz pour lequel des modèles préexistants (projets VPalm et Cereals) seront réutilisés.
Le travail de l’étudiant(e) consistera en :
– Définition d’un protocole d’échange d’informations spatiales et de synchronisation entre simulateurs.
– Formalisation d’une stratégie de distribution des simulations sur plusieurs machines ou clusters.
– Application à la création d’un modèle de système agroforestiers Palmier-Riz avec caractérisation de la dynamique de la distribution de la lumière au cours d’un cycle de croissance.

Profil du candidat :
– Goût pour la simulation 3D des plantes.
– Aptitude à travailler en équipe.
– Autonome (possible situation de télétravail).

Formation et compétences requises :
– Informaticien(ne) motivé(e) et curieux(se).
– Bonne connaissance du Python et/ou C++.
– Connaissance en calculs parallèles et distribués (MPI, OpenMP, Sparks).

Adresse d’emploi :
Avenue d’Agropolis, TA 178/04, 34398 Montpellier

Document attaché : 202012030946_offre-stage-calcul-distribue-DIGITAG-2021-vf.pdf

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire ICube, Strasbourg
Durée : 6 mois
Contact : cedric.bobenrieth@ecam-strasbourg.eu
Date limite de publication : 2021-01-31

Contexte :
À l’apogée de l’industrie 4.0, la conception de nouvelles méthodes et applications permettant un suivi et un
contrôle de la production est un réel enjeu. Le projet 3D-PRIAD se concentre spécifiquement sur les
problématiques liées à la production par impression 3D.
En effet, il est nécessaire qu’une imprimante 3D puisse fonctionner de manière autonome en permanence tout
en assurant une production de pièces de bonnes qualités, c’est-à-dire dépourvue de quelconques défauts
d’impressions.
L’équipe MLMS (Machine Learning, Modeling & Simulation) et l’équipe IGG proposent donc un projet
combinant le deep learning à l’analyse d’images et de modèles 3D afin de permettre un suivi en temps réel de
la qualité de l’impression et la détection automatique d’anomalies.
La mission aura lieu sur 6 mois, entre février et août 2021, et se déroulera au sein de l’équipe MLMS du
laboratoire ICube.

Sujet :
L’objectif du stage est de mettre au point une application permettant de déterminer la qualité d’une impression
à partir de capteurs vidéo ; c’est-à-dire être capable de déterminer automatiquement si l’impression est bonne
ou si elle contient des défauts et, le cas échéant, être capable d’indiquer de quel type de défaut il s’agit.
Pour ce faire vous disposerez des données suivantes :
• Ensemble des images obtenues par 5 caméras positionnées de manière à filmer l’ensemble du
processus d’impression 3D selon les 4 côtés (frontal, arrière, gauche et droite) ainsi qu’une vue
de haut. Ces images seront obtenues tout au long du processus, et pas uniquement lorsque
l’impression est terminée. Ceci est nécessaire car certains défauts ne sont plus détectables une
fois le processus fini.
• Le modèle 3D correspondant à la pièce en cours d’impression
Ces données seront issues à partir d’une imprimante 3D Prusa I3 MK3S, machine présente dans la Zone ICube
de l’Ecam et tournant en moyenne 360 heures/mois, nous assurant ainsi d’avoir un jeu de données suffisamment
conséquent pour être traité au cours du projet.
Les méthodes mises en place pour permettre cette analyse de qualité devront ainsi prendre en considération les
5 angles de vues de l’impression ainsi que le modèle 3D attendu. Parmi les approches possibles, deux pistes sont
envisagées :
• La mise en place d’un réseau de neurones multi-classification qui serait chargé de détecter directement
les défauts d’impression sur les images
• Une méthode de reconstruction de modèle 3D à partir des images des caméras pour permettre
d’effectuer un comparatif par rapport au modèle 3D attendu.
Les principales étapes du projet, en plus de l’étude bibliographique, sont :
• Analyse des différents défauts pouvant arriver au cours d’une impression, et détermination des
caractéristiques permettant de les identifier
• Analyse et pre-processing des données (nettoyage des données, labélisation, …)
• Mise en place d’un réseau de neurones permettant une identification des défauts d’impression et
s’assurant une correspondance avec le modèle 3D original
• Intégration de l’application d’analyse de qualité à une Application Web permettant à l’opérateur un
suivi de l’impression
• Optimisation de l’application pour permettre une analyse en temps réel
Le livrable comprend :
• L’application d’analyse de qualité de l’impression
• Une démonstration impliquant la mise en production de l’application sur l’imprimante pour test en
conditions réelles
• Un document de conception (en anglais)
• Rapport de Master/Fin d’étude
• Soutenance.
Il pourra être adapté selon l’évolution du projet.

Profil du candidat :
L’offre s’adresse à un étudiant en M2, ou dernière année d’école d’ingénieur avec de fortes compétences en
informatiques, et notamment en Python.
Des connaissances sur les réseaux de neurones, le traitement et l’analyse d’images et/ou la modélisation 3D
sont un plus.

Formation et compétences requises :
Master 2 informatique ou équivalent.

Adresse d’emploi :
Place de l’hôpital, Strasbourg (67), France

Document attaché : 202012091222_Sujet stage 3DPRIAD_Master2 Recherche.pdf

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : ICube
Durée : 6 mois
Contact : aurelie.leborgne@unistra.fr
Date limite de publication : 2021-01-31

Contexte :
Valoriser les grandes masses de données spatio-temporelles disponibles dans différents domaines est crucial. Ceci nécessite de concevoir et de développer des approches innovantes aptes à traiter conjointement les aspects spatiaux et les aspects temporels, ce qui n’est que peu le cas avec les méthodes actuelles. Si les graphes, outils puissants à la fois théoriquement et méthodologiquement, sont utilisés pour modéliser des phénomènes temporels ou spatiaux, les méthodes actuelles de fouille, d’analyse et d’extraction de connaissances n’exploitent, en général, qu’une seule dimension de l’information, spatiale versus temporelle. Cela implique souvent une perte de précision et possibilité d’interprétation des résultats. C’est pourquoi nous nous proposons d’exploiter un modèle de graphe spécifique intégrant différents types de relations, les graphes spatio-temporels.

Sujet :
L’objectif général est d’étudier et développer des techniques pour trouver dans de grands graphes spatio-temporels, des motifs, ou répétitions, auxquels les experts du domaine concerné peuvent donner sens. Plus précisément, il s’agit de mettre en oeuvre des techniques de recherche de motifs (sous-graphes fréquents) sur des jeux de données réelles : images satellitaires, bd géographiques, IRM fonctionnelle (en relation avec des experts de ces domaines). La ou le stagiaire s’appuiera pour cela sur les outils disponibles au laboratoire (pour la construction des graphes et pour l’extraction des motifs) mais devra aussi adapter ou améliorer ces outils. Les tâches suivantes seront à réaliser :
– Bibliographie
– Sélection et prétraitement des données
– Transformation : génération de graphes spatio-temporels, incluant la modélisation des relations spatiales et spatio-temporelles adéquates
– Recherche des motifs fréquents ; extension de l’approche aux motifs inexacts (approximation des étiquettes, ou du nombre d’arêtes et de sommets) et trajectoires,
– Interprétation et comparaison des résultats sur (au moins) deux jeux de données

En fonction de l’avancée, on pourra aussi envisager de comparer les résultats obtenus en recherchant des motifs inexacts dans des données précises ou des motifs exacts dans des données imprécises (par exemple en utilisant des étiquettes floues ou plus générales). L’objectif final est de construire une chaîne de traitement incluant l’ensemble des opérations sur les données d’un domaine.

Profil du candidat :
Autonome en programmation (de préférence Python), connaissances sur les graphes et les réseaux de neurones, intérêt pour le développement expérimental.

Formation et compétences requises :
Master 2 informatique ou équivalent

Adresse d’emploi :
300 bd Sébastien Brant à Illkirch

Document attaché : 202010150920_stages2021-donneesReelles.pdf