Annonce en lien avec l’Action/le Réseau : ReProVirtuFlow /
Thème :
Reproductibilité d’analyse de données
Présentation :
Dans le cadre de notre action, nous lançons l’organisation d’une série de ReproHackathons visant à tester les capacités des systèmes de workflows disponibles (au sens large : snakemake, galaxy, nextflow mais aussi les Notebooks Jupyter voire l’utilisation de librairies…) à reproduire une expérience scientifique.
Chaque ReproHackathon fournira aux participants : (1) un accès au Cloud de l’Institut Francais de Bioinformatique, (2) un ou des cas d’utilisation fixés issus de publications scientifiques. Lea seconde édition des reprohackathons se focalisera sur des cas d’analyse de données phylogénétiques. Les participants pourront se regrouper en équipes et choisir un cas d’utilisation parmi ceux proposés, un système de workflows pour implémenter le cas d’utilisation et tester s’ils retrouvent les résultats attendus.
Du : 2018-07-09
Au : 2018-07-10
Lieu : Lyon, Campus LyonTech – la Doua
Site Web : https://ifb-elixirfr.github.io/ReproHackathon/hackathon_2_programme.html