Offre de thèse – modèles génératifs profonds pour la génération procédurale et la génération procédurale inverse

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Laboratoire/Entreprise : IGN-ENSG, LASTIG, Université Gustave Eiffel
Durée : 36 mois
Contact : nicolas.audebert@ign.fr
Date limite de publication : 2025-03-16

Contexte :
L’entraînement de modèles d’apprentissage profond pour l’interprétation d’images aériennes et satellitaires requiert de grandes quantités de données annotées. Toutefois, si d’importants volumes de données d’Observation de la Terre (OT) sont disponibles grâce aux satellites européens Sentinel-2 et aux programmes français d’imagerie SPOT et BDORTHO, cette masse de données est non-étiquetée. En effet, peu d’images de télédétection sont annotées avec des information sémantiques utiles pour entraîner des modèles profonds. Ce phénomène est d’autant plus critique pour la cartographie d’urgence: les catastrophes naturelles sont des événements rares, ce qui réduit d’autant les images disponibles.
Pour pallier ces difficultés, la recherche en intelligence artificielle s’est intéressée à la génération de bases de données d’images synthétiques. La popularisation de l’intelligence artificielle dite générative permet ainsi de produire des jeux de données annotés, en générant des images diverses dans des configurations connues. La génération procédurale est en outre un procédé historiquement bien connu dans la communauté du jeu vidéo, permettant de produire rapidement de grands mondes virtuels en trois dimensions.

Sujet :
L’objectif principal de cette thèse est de combiner les forces de l’apprentissage profond et de la génération procédurale basée grammaire pour les données géospatiales.
La génération procédurale désigne les algorithmes de création de contenu, en particulier pour le jeu vidéo. Ces techniques permettent de créer des mondes virtuels cohérents , notamment pour la modélisation et la simulation du réel, La génération procédurale connaît un regain de popularité car elle permet de produire de grands volumes de données synthétiques annotées, sur lesquels entraîner des réseaux de neurones profonds . Historiquement, la génération procédurale s’est appuyé sur quatre grande familles de méthodes: les approches basées exploration, les approches par satisfaction de contraintes, les méthodes basées grammaire et les approches par apprentissage.
Les approches basées grammaire (ou assimilées, par exemple basées système-L ) sont particulièrement intéressantes. Elles se fondent sur un langage formel qui définit quelles sont les instances acceptables des objets à générer. Cette grammaire permet d’inclure une connaissance experte et peut être considérée comme interprétable. Cependant, définir manuellement une grammaire requiert une certaine expertise et implique souvent une approche itérative par essai-erreur. En comparaison, la génération procédurale par apprentissage statistique permet d’apprendre à générer des objets à partir d’un corpus existant. Toutefois, les modèles appris sont susceptibles de générer des objets inacceptables (par exemple, des maisons sans aucune porte). Par ailleurs, les approches récentes, notamment par apprentissage profond, nécessitent des jeux de données de grande taille pour exceller, ce qui n’est pas toujours possible. En particulier, les entités géographiques urbaines (typiquement les routes et les bâtiments) doivent respecter des a priori géométriques forts qui peuvent être complexes à satisfaire.
Ce sujet de thèse s’intéresse ainsi à l’hybridation entre la génération procédurale symbolique, en particulier exploitant les grammaires, et l’apprentissage profond. Des approches hybrides peuvent permettre d’apprendre à partir de moins d’exemples, tout en respectant mieux les contraintes imposées sur les données par une grammaire.
L’objectif est double:
1. Dans un premier temps, il s’agit de concevoir des architectures génératives de réseaux de neurones dont les sorties sont contraintes par une grammaire. Ainsi, le modèle sera garanti de ne générer que des objets acceptables vis à vis d’une grammaire fournie par l’usager . Plus précisément, on s’intéressera:
• à contraindre les cartes de segmentation d’un modèle prédictif à respecter une grammaire sur l’agencement spatial des objets,
• ou bien à des modèles génératifs qui ne peuvent produire que des objets acceptables selon une grammaire imposée, par exemple de bâtiments.
2. Dans un second temps, de développer des modèles capables d’inférer tout ou partie d’une grammaire à partir d’un corpus d’exemples (génération procédurale inverse et inférence de grammaire). En particulier, on cherchera:
• des méthodes capables d’apprendre automatiquement les symboles terminaux du langage, notamment à l’aide de l’apprentissage de prototypes ,
• puis à des méthodes capables de déduire les règles de production de la grammaire .
Ces techniques de génération seront appliquées à divers types de données géospatiales en 2D et 3D pour la génération de villes . En particulier, les applications pourront inclure les plans cadastraux (emprises au sol de parcelles et de bâtiments), des modèles 3D de bâtiments (produits manuellement ou extraits du Lidar HD) ou des cartes d’occupation du sol.

Profil du candidat :
Le ou la candidate idéale dispose d’une formation de niveau bac+5 (master ou ingénieur) dans l’un des domaines suivants: science des données, jeu vidéo, géomatique. Il ou elle démontre une expérience de la programmation, en particulier avec le langage Python. Une connaissance des outils de gestion projet informatique, notamment Git, sera appréciée. Une bonne maîtrise de l’anglais (écrit et oral) est un pré-requis. Sans être indispensable, une première expérience avec la génération procédurale, les modèles profonds génératifs ou les données géospatiales est un plus.

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
LASTIG, IGN-ENSG, 6-8 avenue Blaise Pascal, Champs-sur-Marne

Document attaché : 202501071048_doctorant.pdf

Hybrid AI for the prevention of toxic smoke inhalation risk among firefighters

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Laboratoire/Entreprise : Connected Health Lab (Ecole d’ingénieurs ISIS) Ca
Durée : 36
Contact : francis.faux@univ-jfc.fr
Date limite de publication : 2025-02-28

Contexte :
The aim of the project is to trace the toxic products “inhaled” by firefighters during their various interventions.

Sujet :
The first stage of the thesis will be to make the real-time acquisition system operational and reliable,
and to contextualize it according to the type of fire (apartment, forest).
The second objective of the thesis will be:
– to study hybrid online and multi-source learning models for modeling the toxicity of different types of fire, in order to infer the duration
of exposure to different toxic products (taking into account the randomness of the context)
– to develop a medical decision support tool under uncertainty to identify at-risk firefighter profiles.
Given a firefighter’s history, it will be possible to deduce the arguments that point to a certain level
of risk associated with the development of different diseases. To this end, work on Bipolar Layered argumentative
Frameworks could be adapted to temporal data and, if necessary, enriched.

Profil du candidat :
We are looking for a candidate with a strong AI background, particularly in machine learning. Knowledge of uncertainty modeling in AI will be highly appreciated.

Formation et compétences requises :
Master2

Adresse d’emploi :
Ecole d’ingénieurs ISIS, rue Firmin Oulès, 81100 Castres (france)

Document attaché : 202501061422_Thesis-AI_hybrid.pdf

Modèle de langue à base de connaissance experte pour l’extraction d’information médicale à partir de données non structurées.

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Laboratoire/Entreprise : Institut de Recherche en Informatique de Toulouse
Durée : 5-6 mois
Contact : yohann.chasseray@irit.fr
Date limite de publication : 2025-03-01

Contexte :
Le stage sera réalisé au sein de l’équipe SIG, dans le département Gestion de Données de l’Institut de Recherche en Informatique de Toulouse (IRIT). L’IRIT est un laboratoire de recherche constitué de chercheurs en informatique, développant notamment des travaux autour du traitement automatique du langage, de la gestion des données, des connaissances et de l’extraction d’informations.
Le stage sera localisé sur le Campus de Castres, dans les locaux de l’école d’ingénieurs ISIS, qui forme des ingénieurs en informatique dans le domaine de la santé numérique. Des déplacements à Toulouse dans les locaux de l’IRIT sont à prévoir.

Sujet :
Les grands modèles de langue qui n’ont de cesse de se perfectionner représentent un outil puissant pour la compréhension fine des connaissances dans un contexte général mais également de manière plus spécialisée, dans des domaines métier spécifiques comme celui de la santé médicale. Notamment, les grands modèles de langue (LLMs) constituent une base solide pour la détection d’entités nommées (NER) ou de relation (RE) qui sont des tâches majeures pour le traitement des données médicales.
L’objectif de ce stage est donc de proposer des méthodes d’extraction d’entités nommées s’appuyant à la fois sur les LLMs (Phi-3 [1], BERT [2]) et sur des ontologies médicales (SNOMED CT [3], UMLS [4]), qui renferment des informations sémantiques précises sur les entités et relations recherchées. Pour cela, deux approches sont envisagées, s’appuyant toutes les deux sur les grands modèles de langues :
(A) Une approche qui utilise le contexte, permettant de guider un modèle de langue génératif en sélectionnant les types d’entités les plus pertinents dans une ontologie pour l’extraction d’entités nommées ou de relations.
(B) Une approche plus intégrée, visant cette fois à inclure directement la représentation ontologique au cours d’une étape de fine-tuning d’un modèle de langue et à interroger directement le modèle, sans fournir de contexte préalable.
En fonction des avancées, les résultats pourront faire l’objet d’une soumission à la conférence CLEF 2025 (https://clef2025.clef-initiative.eu/).

Profil du candidat :
Etudiant(e) en formation de niveau Bac+4/5, avec une spécialisation en Informatique ou Data Science et présentant des compétences en analyse, traitement et représentation de données.

Formation et compétences requises :
Les compétences suivantes seront fortement appréciées pour mener à bien les missions associées au sujet de stage :
• Bonnes connaissances en programmation (Python) et traitement automatique du langage.
• Connaissances de base sur les ontologies et bases de connaissances.
• Familiarités avec les modèles d’apprentissage automatique en général et le modèle transformer en particulier.

Adresse d’emploi :
Campus Universitaire, Rue Firmin Oulès, 81104 Castres
yohann.chasseray@irit.fr

Document attaché : 202501051355_Offre_de_stage_ISIS_IRIT.pdf

Postdoctoral researcher, IGDR, Rennes, France: use of deep learning and simulation to extract geometric parameters of filaments in microscopy images.

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Laboratoire/Entreprise : Institute of Genetics and Development of Rennes
Durée : 24 months
Contact : helene.bouvrais@univ-rennes.fr
Date limite de publication : 2025-03-01

Contexte :
We wish to welcome a highly motivated postdoctoral researcher in our multi-disciplinary team at the Institute of Genetics and Development of Rennes (https://igdr.univ-rennes.fr/en/). Research in the team focuses on the robustness of cell division through fluorescence microscopy and quantitative biophysical approaches, using the nematode model organism Caernorhabditis elegans. The ongoing development of an automated microscope allows the team to extend its studies to human cell lines in culture, without synchronization, a key requirement for the studying division robustness.

Sujet :
The recruited postdoctoral researcher will be an integral part of the on-going research project, funded by the ANR and focused on the study of the regulatory role of microtubule rigidity in cell division. He/she will work on the development of a tool based on artificial intelligence to extract microtubule curvatures from 3D fluorescence microscopy images. In particular, the candidate will use synthetic image generation through simulation (e.g., Cytosim) and deep learning techniques. For this, he/she will have access to local computing servers as well as remote ones (e.g., Jean Zay). Filament curvature measurements will help reveal potential disruptions in microtubule rigidity during genetic perturbation or across cell lines with deregulated expression of candidate proteins involved in regulating microtubule rigidity.

Profil du candidat :

Formation et compétences requises :
– Hold a PhD degree in computer science, machine learning or applied mathematics.
– Have strong theoretical and practical skills in deep learning.
– Master programming languages such as Python.
– Have proven experience in implementing deep learning in image analysis.
– Be able to work collaboratively within a research team ; be a team player.
– Have strong organizational and communication skills, including the ability to express oneself and write in English.
– Ability to work independently.
– Have an interest in working in a multidisciplinary environment (cellular biology, fluorescence microscopy, soft matter physics, bioinformatics)

Adresse d’emploi :
IGDR (Institute of Genetics and Developemnt of Rennes), CNRS, Univ. Rennes, UMR 6290
2 avenue du Professeur Léon Bernard, 35000 Rennes cedex, France

Document attaché : 202501031145_Annonce_post-doc_informatique_ANR_Micenn_EN.pdf

Estimating intracranial pressure by wide-band tympanometry signal analysis through neural networks

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Laboratoire/Entreprise : Laboratoire ImViA, Dijon, France & CHU Dijon, Fran
Durée : 6 mois
Contact : franck.marzani@u-bourgogne.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Wide-band tympanometry (WBT) is a routine and non-invasive clinical tool to estimate the micromechanical properties of the middle and inner ears. The system delivers a pure-tone signal into the ear at several frequencies and records the reflecting signal in the ear canal. Il also analyses the absorbance at different pressures in the ear canal (-300 to +300 daPa). It estimates the reflectance and the absorbance of the recorded sound and thus provides interesting indicators of tympanic membrane and ossicular chain mobility, and middle ear pressure. The ear is connected to the intracranial space through the inner ear structures. An increase in the intracranial pressure (ICP) changes the micromechanical properties of the middle ear and the WBT signal. The relation between intracranial pressure and WBT signal alterations is complex and poorly studied. The WBT signal varies between individuals and these 2 obstacles hamper the estimation of intracranial pressure by WBT. Monitoring the ICP is crucial in patients undergoing intracranial surgical procedures or in those with head trauma. The gold standard for measuring ICP is invasive pressure sensors placed inside the head. Developing non-invasive ICP measurements would be a significant breakthrough in the neurosurgical field.
We have undertaken a clinical study in the intensive care unit (Dijon hospital) for the measurement of ICP with the intracranial invasive system and multiple WBT recordings on both ears in 20 patients after head trauma or surgery. The database includes 1200 recordings with corresponding invasive ICP values (ground truth). Each WBT recording is composed of absorbance values for probe sound frequencies ranging from 120 to 8000 Hz and for ear canal pressures ranging from -300 to +300 daPa).

Sujet :
The aim of the study is to develop a neural network to analyze the data and to estimate the ICP in 3 categories of pressure (low, medium, high). As a first step, the person recruited will have to understand the physical meaning of the signals handled. He/she will then have to propose and implement a deep learning architecture capable of modeling the relation between ICP and WBT signals in order to meet the objective of estimating.
This study opens insights to the understanding of the mechanisms connecting the middle ear micromechanics and ICP.

Profil du candidat :
Master or engineering student in imaging, computer vision.
Strong skills in image analysis, AI, programming such as Python.
Interest in working as part of a team in an interdisciplinarity environment. Interest in healthcare applications.
Enthusiasm for research. Autonomy.

Formation et compétences requises :
Applicants are invited to submit their application to: Franck MARZANI (franck.marzani@u-bourgogne.fr) and Alexis BOZORG GRAYELI (alexis.bozorggrayeli@chu-dijon.fr).
Application must contain the following documents: cover letter, CV, transcript of the last 2 years, at least 2 reference letters or referral contacts.

Adresse d’emploi :
Laboratoire ImViA, Dijon, Université de Bourgogne

Analyse numérique de l’engagement d’apprenants dans des situations d’apprentissage en ligne

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Laboratoire/Entreprise : CReSTIC – Université de Reims Champagne-Ardenne
Durée : 4 à 6 mois
Contact : bart.lamiroy@loria.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Ce travail se place dans un projet de recherche en collaboration avec Santé Publique France.
Ce stage de Master se situe en amont et en parallèle des recherches menés dans le cadre de ce projet et consiste à choisir et mettre en place les outils adéquats en analyse statistique de données et d’extraction de connaissances à partir de traces d’interaction avec un site d’apprentissage en ligne afin de mesurer l’impact de l’outil de formation et de mesurer l’engagement des apprenants dans leur démarche.

Sujet :
Le but est d’établir des profils d’usagers à partir des interactions de ceux-ci avec une plateforme d’apprentissage en ligne, afin d’évaluer l’adéquation de l’outil numérique proposé, et de faire des préconisations pour son évolution à partir de données anonymisées.

• Il s’agira de concevoir et appliquer des outils d’analyse statistique des données et d’extraction de connaissances à partir des données de cette expérimentation.
• Des algorithmes d’analyse de données et de classification seront utiles pour mettre en exergue des corrélations, interdépendances ou autres similarités dans les parcours d’apprentissage.

Profil du candidat :

Formation et compétences requises :
La candidate ou le candidat a in niveau de formation M2 et une bonne connaissance en analyse de données numérique et de programmation. Elle ou il maîtrise Python ou R.
La curiosité, l’autonomie et le sens de travail en équipe seront également des facteurs déterminants.

Adresse d’emploi :
CReSTIC
UFR Sciences Exactes et Naturelles
Moulin de la Housse – BP 1039
51687 Reims CEDEX 2
https://crestic.univ-reims.fr/fr/accueil

Document attaché : 202412201243_Sujet Master 2.docx

Estimating intracranial pressure by wide-band tympanometry signal analysis through neural networks

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire ImViA, Dijon, France & CHU Dijon, Fran
Durée : 6 mois
Contact : franck.marzani@u-bourgogne.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Wide-band tympanometry (WBT) is a routine and non-invasive clinical tool to estimate the micromechanical properties of the middle and inner ears. The system delivers a pure-tone signal into the ear at several frequencies and records the reflecting signal in the ear canal. Il also analyses the absorbance at different pressures in the ear canal (-300 to +300 daPa). It estimates the reflectance and the absorbance of the recorded sound and thus provides interesting indicators of tympanic membrane and ossicular chain mobility, and middle ear pressure. The ear is connected to the intracranial space through the inner ear structures. An increase in the intracranial pressure (ICP) changes the micromechanical properties of the middle ear and the WBT signal. The relation between intracranial pressure and WBT signal alterations is complex and poorly studied. The WBT signal varies between individuals and these 2 obstacles hamper the estimation of intracranial pressure by WBT. Monitoring the ICP is crucial in patients undergoing intracranial surgical procedures or in those with head trauma. The gold standard for measuring ICP is invasive pressure sensors placed inside the head. Developing non-invasive ICP measurements would be a significant breakthrough in the neurosurgical field.
We have undertaken a clinical study in the intensive care unit (Dijon hospital) for the measurement of ICP with the intracranial invasive system and multiple WBT recordings on both ears in 20 patients after head trauma or surgery. The database includes 1200 recordings with corresponding invasive ICP values (ground truth). Each WBT recording is composed of absorbance values for probe sound frequencies ranging from 120 to 8000 Hz and for ear canal pressures ranging from -300 to +300 daPa).

Sujet :
The aim of the study is to develop a neural network to analyze the data and to estimate the ICP in 3 categories of pressure (low, medium, high). As a first step, the person recruited will have to understand the physical meaning of the signals handled. He/she will then have to propose and implement a deep learning architecture capable of modeling the relation between ICP and WBT signals in order to meet the objective of estimating.
This study opens insights to the understanding of the mechanisms connecting the middle ear micromechanics and ICP.

Profil du candidat :
Master or engineering student in imaging, computer vision.
Strong skills in image analysis, AI, programming such as Python.
Interest in working as part of a team in an interdisciplinarity environment. Interest in healthcare applications.
Enthusiasm for research. Autonomy.

Formation et compétences requises :
Applicants are invited to submit their application to: Franck MARZANI (franck.marzani@u-bourgogne.fr) and Alexis BOZORG GRAYELI (alexis.bozorggrayeli@chu-dijon.fr).
Application must contain the following documents: cover letter, CV, transcript of the last 2 years, at least 2 reference letters or referral contacts.

Adresse d’emploi :
Laboratoire ImViA, Dijon, Université de Bourgogne

Metalearning for Healthcare: Exploring Hierarchical Representations with Poincaré Variational Auto-Encoders

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Laboratoire/Entreprise : IBISC, Univ. Évry Paris-Saclay/MIT
Durée : 6
Contact : massinissa.hamidi@univ-evry.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Context
This project will lead to concrete machine learning empirical insights intended to be exploited in the larger context of IHU Prometheus, a multi-year large-scale research and training institute for understanding sepsis disease. The student will also have the opportunity to get involved in ongoing collaboration with the IMES at MIT.

Sujet :
Project description

Machine learning is increasingly used in healthcare applications to assist medical staff in diagnosing their patients and providing tailored medications. Many real datasets in healthcare are hierarchically structured. However, traditional machine learning models map the data to Euclidean latent space, which cannot efficiently handle tree-like structures. This is the case with variational auto-encoders (VAEs), a powerful type of machine learning model that is widely used for generative purposes. In particular, they allow capturing explainable factors of variation, an important property that we seek in healthcare applications. In this project, we are interested in exploring the benefits of hierarchical representations for healthcare applications with a particular kind of VAEs which are embedded in hyperbolic spaces [1, 2].

As a starting point, we will take a look at this paper “Continuous Hierarchical Representations with Poincaré Variational Auto-Encoders” [1] and adapt it to a healthcare application. The goal is to leverage meta-knowledge [3] about the learning problem, for example, the hierarchical structure of the labels to improve the learning process. In particular, we are interested in assessing what happens for the learning process and the learned representations when choosing appropriate parameterizations (here, leveraging the hierarchical structure of the target labels) compared to when we simply map data to the Euclidean latent space, i.e., flatten the target labels and ignoring their hierarchical structure. Other VAEs that feature hyperbolic embedded spaces, such as [2, 4, 5] will also be explored and compared to basic Euclidean embedded space in terms of performances, representational properties, and learning bounds.

The experiments will be performed on the MIMIC-IV dataset [6], a freely available real-world dataset encompassing electronic health records of patients admitted to intensive care units. The idea is to adapt one of the healthcare learning problems featured in MIMIC-IV dataset to a hierarchical representation learning problem.

We seek to publish the obtained results in machine learning and machine learning for healthcare related workshops or conference venues.

Contact
Massinissa HAMIDI
Maître de conférences
IBISC Laboratory, Univ. Évry Paris-Saclay massinissa.hamidi@univ-evry.fr

Li-wei H. LEHMAN
Research Scientist
Massachusetts Institute of Technology lilehman@mit.edu

Bibliography
[1] Mathieu E, Le Lan C, Maddison CJ, Tomioka R, Teh YW. Continuous hierarchical representations with poincaré variational auto-encoders. Advances in neural information processing systems. 2019;32.

[2] Bose, Joey, et al. “Latent variable modelling with hyperbolic normalizing flows.” International conference on machine learning. PMLR, 2020.

[3] Hamidi, Massinissa. Metalearning guided by domain knowledge in distributed and decentralized applications. Diss. Université Paris-Nord-Paris XIII, 2022.

[4] Davidson, Tim R., et al. “Hyperspherical variational auto-encoders.” 34th Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence 2018, UAI 2018. Association For Uncertainty in Artificial Intelligence (AUAI), 2018.

[5] Cho, Seunghyuk, Juyong Lee, and Dongwoo Kim. “Hyperbolic VAE via latent Gaussian distributions.” Advances in Neural Information Processing Systems 36 (2024).

[6] A. E. Johnson, L. Bulgarelli, L. Shen, A. Gayles, A. Shammout, S. Horng, T. J. Pollard, S. Hao, B. Moody, B. Gow, et al. Mimic-iv, a freely accessible electronic health record dataset. Scientific data, 10(1):1, 2023.

Profil du candidat :
Niveau Master, MSc ou Programme Grande Ecole

Formation et compétences requises :

Adresse d’emploi :
23 Bd de France-Georges Pompidou, 91037 Évry-Courcouronnes

Document attaché : 202412191341_2425-UPSay-MIT-internship-Metalearning-Poincare-VAE.pdf

Offre de stage M2 – Projet CALYPSO (Clinique et AnaLYses PSychiatriques Objectives)

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : TIDS/– — –

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire CRIStAL (Université de Lille)
Durée : 12 semaines minimum
Contact : mathilde.regue@univ-lille.fr
Date limite de publication : 2025-03-31

Contexte :
Le projet CALYPSO : Vers une psychiatrie de précision
CALYPSO est un projet de recherche interdisciplinaire de l’Université de Lille qui réunit des chercheurs en intelligence artificielle, psychiatrie, psychologie et neurosciences issus du laboratoire CRIStAL, du centre Lille Neuroscience et Cognition et du SCALab. Le projet CALYPSO vise à identifier des marqueurs objectifs des troubles psychiatriques pour améliorer la précision des diagnostics, la prédiction du pronostic et de la réponse aux traitements, et personnaliser les interventions.

Contexte sociétal du projet :

Les troubles psychiatriques touchent aujourd’hui près d’une personne sur huit dans le monde, faisant de la santé mentale un enjeu majeur de santé publique. Cette situation s’intensifie face aux crises globales qui amplifient la prévalence des troubles tels que la dépression et le trouble de stress post-traumatique (TSPT). Bien que la recherche en psychiatrie ait permis des avancées significatives, les mécanismes sous-jacents à ces troubles demeurent encore peu voire pas connus, et les découvertes peinent souvent à se traduire dans la pratique clinique.

Quelques chiffres… L’ampleur des troubles visés par CALYPSO

*300 millions : Nombre de personnes affectées par la dépression dans le monde
*70 % : Proportion des individus exposés à des événements potentiellement traumatiques au cours de leur vie
*24 % : Prévalence du TSPT suite à un événement traumatique

Description du projet CALYPSO :

Le projet CALYPSO vise à enrichir la définition des troubles psychiatriques grâce à des marqueurs objectifs, rendus possibles par les technologies d’intelligence artificielle et de vision par ordinateur. Les marqueurs objectifs incluent des indicateurs mesurables et quantifiables tels que les expressions faciales, les tonalités de voix, les comportements moteurs, et les données physiologiques (par exemple, rythme cardiaque, respiration). En permettant d’étudier des groupes de patients plus homogènes, ces avancées offriraient une voie vers des traitements plus ciblés, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives pour répondre aux besoins spécifiques de chaque patient.

Sujet :
Missions du stage:

Durant ce stage, l’étudiant ou l’étudiante s’intéressera au développement de méthodes de machine learning adaptées au projet.

Ses missions seront :

*Développer et mettre en œuvre un algorithme d’analyse pour un des marqueurs objectifs enregistrés (expressions faciales / mouvements du visage / vitesse de déplacement / analyse de la voix…).
*Utiliser des techniques d’apprentissage automatique pour identifier des sous-groupes de patients en fonction des marqueurs objectifs.
*Effectuer des évaluations expérimentales des algorithmes et techniques développés.
*Discuter avec des équipes interdisciplinaires pour intégrer les résultats dans la pratique clinique.

Profil du candidat :
Étudiant ou étudiante en M2 dans un Master en informatique, en intelligence artificielle, ou dans un domaine connexe.

Formation et compétences requises :
*Connaissance en vision par ordinateur, apprentissage automatique et intelligence artificielle.
*Connaissance de travail avec des ensembles de données à grande échelle et de réalisation d’évaluations expérimentales.
*Compétences en programmation en Python. Une connaissance des bibliothèques de vision par ordinateur telles que OpenCV, TensorFlow, PyTorch ou similaires serait un avantage.
*Compétences analytiques et en résolution de problèmes.

Adresse d’emploi :
Infos pratiques :
La durée du stage sera de minimum 12 semaines.
Le projet sera encadré par les Pr. Mohamed Daoudi (UMR 9189 CRIStAL – Computer Science et AI), Pr Ali Amad (UMR-S 1172 et CHU de Lille –Psychiatrie) et Dr Fabien D’Hondt (UMR-S 1172 – Neurosciences).
Le stagiaire sera principalement localisé dans les locaux du laboratoire CRIStAL, campus Cité Scientifique et ponctuellement au centre Lille Neuroscience et Cognition.

Contact : Pour postuler à cette offre, merci d’envoyer un CV ainsi qu’une lettre de présentation à : mathilde.regue@univ-lille.fr

Document attaché : 202412190951_Offre de stage M2 – Projet CALYPSO.pdf

Appel à communications – ORASIS (9-13 juin 2025) : journées francophones des jeunes chercheurs en vision par ordinateur

Date : 2025-06-09 => 2025-06-13
Lieu : Le Croisic

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Appel à communications

ORASIS 2025 : 9-13 juin 2025 au Croisic
Date limite de soumission : 14 février 2025
Site web : https://orasis2025.sciencesconf.org/
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La 20ème édition d’ORASIS, journées francophones des jeunes chercheurs en vision par ordinateur sera organisée 9 au 13 juin 2025 au Domaine de Port aux Rocs au Croisic. Cette édition est organisée par l’équipe Vision-AD avec Thibault Napoléon du LabISEN et en étroite collaboration avec Ayoub KARINE (MCF à l’Université Paris Cité depuis 09/2024).

Ce colloque vise à réunir de jeunes chercheurs francophones (doctorants et jeunes docteurs) issus de la communauté de la vision par ordinateur ou de domaines connexes, avec l’ambition de favoriser, dans une ambiance conviviale, les échanges entre les participants. Les journées seront rythmées par des sessions plénières, des sessions posters et par plusieurs conférenciers invités.

Liste des orateurs invités :
– Catherine Borremans, IFREMER
– Patrick Le Callet, Nantes Université
– Sébastien Lefèvre, Université Bretagne Sud
– Olivier Lézoray, Université Caen Normandie
– Alice Othmani, Université Paris-Est Créteil
– Lauréat du prix de thèse AFRIF

Dates importantes :
– Ouverture de la soumission des articles : 13 janvier 2025
– Fermeture de la soumission des articles : 14 février 2025
– Notification aux auteurs : 2 avril 2025
– Version finale des articles :18 avril 2025
– Ouverture des inscriptions : 3 avril 2025
– Inscription non majorée : Avant le 2 mai 2025
– Dates de la conférence : 9 – 13 Juin 2025

Liste des thèmes :
– vision et géométrie
– vision dynamique et asservissement visuel
– vision active (stratégie de perception et d’action)
– vision robotique
– réalité virtuelle
– modélisation 3D
– analyse du mouvement et de scènes
– suivi visuel
– modèles déformables
– reconnaissance
– apprentissage
– classification
– interprétation
– indexation multimédia
– segmentation
– compression

Pour toute question sur ce colloque, merci de nous envoyer un email : orasis2025@sciencesconf.org

En vous souhaitant nombreux au Croisic !

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Ayoub Karine (MCF à l’Université Paris Cité)
Thibault Napoléon (EC à l’ISEN Brest)
Pour le comité d’organisation de la conférence ORASIS 2025

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