Two years post doc in artificial intelligence applied to cancerology

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : Sesstim, Aix Marseille University
Durée : 24 Mois
Contact : raquel.urena@univ-amu.fr
Date limite de publication : 2023-03-31

Contexte :
The Sesstim is a multidisciplinary group with research interest in Artificial intelligence applied to health.
This post doc would be carried out in collaboration with data scientist, oncologist and bio statisticiens.

Sujet :
Applying deep learning and machine learning techniques to model the medical pathway of elderly patients recovering from cancer and predicting fatal events. The data used for the analysis will be electronic health records and medical reimbursement data.

Profil du candidat :
Good knowledge of Machine Learning and Deep Learning approaches.
Python programming, ( Keras, tensorflow, scikit learn)
Data cleaning and preparation skills.
Capacity of dealing with large scale datasets
Good publication records in the field of computer science and artificial intelligence.

Formation et compétences requises :
PhD in computer science or artificial intelligence.

Master in Computer Science or related field.

Solid programming knowledge

Adresse d’emploi :
Sciences Economiques et Sociales de la Santé et Traitement de l’Information Médicale
Faculté des sciences médicales et paramédicales – 27 Bd Jean Moulin 13385 Marseille Cedex 5 FRANCE

ComSciCon France – Conférence de formation à la communication scientifique pour les doctorant.es

Date : 2023-07-03 => 2023-07-05
Lieu : Nancy (Campus Lettres & Sciences humaines)

[À l’attention des doctorants et doctorantes]

Bonjour à toutes et à tous,

ComSciCon France est un workshop de formation à la communication scientifique à destination des doctorant·es de toutes disciplines ! ✨

De retour en 2023 avec une 4ème édition qui se déroulera du 3 au 5 juillet à Nancy (Campus Lettres & Sciences humaines), le programme de ComSciCon France 2023 comprendra des ateliers pratiques, des sessions projets, un exercice d’écriture, un keynote et un panel. Toutes ces sessions aborderont des sujets variés pour couvrir toujours plus de facettes de la communication scientifique et obtenir les compétences nécessaires au partage des sciences.

Les thématiques 2023 ainsi que les modalités de candidatures sont détaillées sur notre site : https://france.comscicon.com/candidature/

Les candidatures sont ouvertes du 13 mars au 26 mars 23h59 avec cette année un nombre de candidatures maximum fixé à 300 candidatures : n’hésite pas plus longtemps et postule pour participer à ce workshop unique en France !

Lien direct


Notre site web : www.madics.fr
Suivez-nous sur Tweeter : @GDR_MADICS
Pour vous désabonner de la liste, suivre ce lien.

1 POSTE PR 27 – UNIVERSITE D’ORLEANS (thématiques bases de données, parallélisme)

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : LIFO, UFR ST
Durée : permanent
Contact : mirian@univ-orleans.fr
Date limite de publication : 2023-03-29

Contexte :
Un poste de professeur des universités est à pourvoir à l’université d’Orléans, avec rattachement recherche au LIFO.

Sujet :
Ce poste est ouvert aux candidatures proposant une intégration dans l’équipe PAMDA du LIFO.

Profil du candidat :
La personne recrutée devra s’intégrer à l’équipe PAMDA/LIFO en contribuant pour la convergence des problématiques gestion de données et calculs intensifs, renforçant soit :
• l’axe BD sur des aspects théoriques ou appliqués de la gestion des données notamment pour les graphes de données (extraction et évolution de schéma, maintenance par rapport à des contraintes, interrogation intelligente et efficace) ;
• l’axe parallélisme sur le parallélisme implicite au sein du workflow pour les étapes d’analyse de données ;
• l’interaction entre les deux axes vers un contexte HPDA.

Formation et compétences requises :
La personne recrutée devra renforcer notre capacité à diriger des recherches, créer des opportunités de collaboration impliquant nos jeunes collègues enseignants-chercheurs ainsi que d’autres laboratoires nationaux ou étrangers. Elle devra s’investir dans l’animation  scientifique et administrative de notre laboratoire;  contribuer à augmenter notre dynamique, étant force de proposition de nouveaux projets.

Les candidatures externes contribuant à améliorer la diversité du laboratoire sont vivement encouragées.

Adresse d’emploi :
POSTE PR 27 – Université d’Orléans
Composante : UFR Sciences et Techniques
Recherche: Laboratoire d’Informatique Fondamentale d’Orléans (LIFO, EA 4022). Équipe PAMDA.
https://www.univ-orleans.fr/lifo/

Pour plus des détails, se référer à:

https://www.univ-orleans.fr/fr/univ/universite/travailler-luniversite/personnels-enseignants-et-chercheurs/enseignants-chercheurs

https://www.univ-orleans.fr/upload/public/2023-02/FOP_0450855K_4555.pdf

https://www.univ-orleans.fr/lifo/equipe.php?id=2

Contact (recherche) :
• Mirian HALFELD FERRARI : mirian@univ-orleans.fr (directrice du LIFO)
Téléphone : 02 38 49 25 83
• Sophie ROBERT : Sophie.Robert@univ-orleans.fr (responsable de l’équipe PAMDA)
Téléphone : 02 38 49 70 87

Contact (enseignement) :
TESSIER Alexandre ou LIEDLOFF Mathieu
Mail : direction.sciences-info@listes.univ-orleans.fr
Téléphone : +33 2 38 41 70 11 et +33 2 38 49 49 10

Document attaché : 202303110737_VfinalCAC-Profil_Poste_PR_27_UFR ST_LIFO.pdf

Mots/Machines #5 : Terminologie

Annonce en lien avec l’Action/le Réseau : SimpleText

Thème :

terminologie, mots-clés

Présentation :

La terminologie est un sujet particulièrement important pour la traduction et la rédaction techniques. La compréhension de documents techniques ou scientifiques peut constituer un défi pour les utilisateurs, notamment les traducteurs, les rédacteurs techniques ou les citoyens, à cause de la terminologie complexe. La recherche de la terminologie et son explication pourraient contribuer à atténuer ce problème. L’un des objectifs de cette journée d’étude est d’explorer les avantages et les limites des technologies d’IA émergentes pour aider un utilisateur à comprendre un document scientifique ou technique complexe.
La journée d’étude vise à offrir une plateforme de communication à une communauté interdisciplinaire de chercheurs en terminologie, traduction, rédaction technique, IA, traitement du langage naturel, recherche d’information, linguistique et didactique.

Du : 2023-03-17

Au : 2023-03-17

Lieu : Université de Bretagne Occidentale

Site Web : https://motsmachines.github.io/2023

DOING@ADBIS 2023: 4th International Workshop on Intelligent Data – From Data to Knowledge

Annonce en lien avec l’Action/le Réseau : DOING

Thème :

The workshop focuses on transforming data into information and then into knowledge. It addresses various aspects of information extraction from textual data, intelligent and efficient interrogation, and maintenance of (large) knowledge bases.

Présentation :

The workshop focuses on transforming data into information and then into knowledge. The idea is to gather researchers to discuss two main problems :

– how to extract information from textual data and represent it in knowledge bases;
– how to propose intelligent methods for handling and maintaining these databases with new forms of requests, including efficient, flexible, and secure analysis mechanisms, adapted to the user, and with quality and privacy preservation guarantees.

Du : 2023-09-04

Au : 2023-09-04

Lieu : Barcelona, Spain

Site Web : https://www.univ-orleans.fr/lifo/evenements/doing/?page_id=995

Poste PR en section 27 – calcul HPC, IA et visualisation scientifique

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –

Laboratoire/Entreprise : LICIIS / Université de Reims Champagne-Ardenne
Durée : 4 ans
Contact : Luiz-Angelo.Steffenel@univ-reims.fr
Date limite de publication : 2023-04-01

Contexte :
Poste PR en section 27 – calcul HPC, IA et visualisation scientifique

Sujet :
Bonjour, un poste PR 27 (Chaire Professeur Junior) est ouvert à l’Université de Reims Champagne-Ardenne.

Profil du candidat :
Le profil du candidat sera à la frontière des domaines du calcul HPC, de l’IA et de la visualisation scientifique (modélisation de synthèse, analyse immersive). La description détaillée du poste se trouve à
https://www.galaxie.enseignementsup-recherche.gouv.fr/ensup/ListesPostesPublies/FIDIS/0511296G/FOPC_0511296G_4550.pdf

Le candidat recruté intégrera le Le Laboratoire d’Informatique en Calcul Intensif et Image pour la Simulation (LICIIS). Le LICIIS est également une unité sous contrat (LRC DIGIT) avec le Commissariat à l’Energie Atomique et aux Énergies Alternatives (CEA), et il est le principal opérateur de deux des plus importantes infrastructures de l’URCA : le Centre de Calcul régional ROMEO (supercalculateur classé au 249ème rang mondial du TOP500 et au 20ème rang du GREEN500 au moment de sa mise en service en 2018) et le Centre Image.

Formation et compétences requises :
L’emploi se fait sur un support CPJ (Chaire Professeur Junior) de 4 ans, avec titularisation dans un poste permanent (à temps plein) à la fin du mandat. Un doctorat en HPC, en visualisation scientifique ou l’équivalent dans un domaine connexe est requis.

Adresse d’emploi :
Les candidatures se font via le site Galaxie. La date limite de dépôt des candidatures est le 30 mars 2023.

Merci de transmettre cette offre aux personnes qui pourraient être intéressées.

contact : luiz-angelo.steffenel@univ-reims.fr / laurent.lucas@univ-reims.fr

Enseignant-chercheur en

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Laboratoire/Entreprise : LIGM
Durée : CDI
Contact : laurent.najman@esiee.fr
Date limite de publication : 2023-04-30

Contexte :
Un poste d’enseignant-chercheur en “data et application” est ouvert à ESIEE Paris – Université Gustave-Eiffel avec intégration recherche au LIGM ( https://siteigm.univ-mlv.fr/ ).

L’Université Gustave Eiffel est susceptible, sous réserve de la validation à venir par les instances, de recruter un enseignant-chercheur ou une enseignante-chercheuse sur un poste permanent en « Données et applications ». La personne recrutée sera affectée à ESIEE PARIS (https://www.esiee.fr/), école membre de l’Université Gustave Eiffel. Le statut est celui de maître ou maîtresse de conférences contractuel (poste permanent de droit public, service d’enseignement de 192 HETD annuel avec activité de recherche, salaire et progression selon la grille des maîtres de conférences).

Sujet :
Vous êtes titulaire d’un doctorat dans le domaine, typiquement en section CNU 27 ou 61, et qualifié⸱e aux fonctions de maître de conférences (ou disposez des éléments permettant d’en apprécier l’équivalence). Votre expérience pédagogique vous permet de vous impliquer à court terme dans différentes filières de formation. Votre potentiel de recherche se traduit par des publications et la participation à des projets de R&D.

Vous serez rattaché⸱e au département IT, informatique et télécommunications, qui a en charge les enseignements d’informatique du tronc commun et les filières d’enseignement suivantes : cybersécurité, datascience et IA, informatique, en formation initiale, ainsi que réseaux et sécurité, informatique, en formation par apprentissage et la filière internationale Artificial Intelligence and Cybersecurity intégralement enseignée en anglais. Votre activité de recherche sera menée soit au sein du laboratoire GRETTIA (Génie des Réseaux de Transport Terrestres et Informatique Avancée) ; soit au sein du laboratoire LIGM (Laboratoire d’Informatique Gaspard Monge), qui sont deux laboratoires de l’université Gustave Eiffel.

Profil enseignement. Vous interviendrez dans les filières de spécialité (Datascience et IA, Artificial Intelligence and Cybersecurity) comme en tronc commun, autour des thématiques liées à la science des données. L’école projette l’ouverture d’une nouvelle filière d’ingénieurs en apprentissage sur le thème « Données et applications », à l’horizon septembre 2024, et vous renforcerez naturellement l’équipe pédagogique chargée d’animer cette nouvelle filière. Vous avez une bonne connaissance théorique et pratique des algorithmes de machine learning, si possible de leur mise en production. L’expérience d’un secteur d’application métier serait un plus, et la curiosité envers les applications appréciée.

Vous participerez à l’encadrement d’étudiants ingénieurs dans des projets comportant une dimension pratique. Un intérêt pour les innovations pédagogiques sera un atout supplémentaire.
Sensible à la dimension internationale de l’enseignement et de la recherche, vous pouvez enseigner en anglais.

Profil recherche. Suivant votre profil et projet, vous vous insérerez soit au laboratoire GRETTIA, soit au laboratoire LIGM, qui sont tous les deux des laboratoires de l’université Gustave Eiffel. Vos travaux attestent d’un fort potentiel et d’une grande autonomie ainsi que d’une bonne aptitude au dialogue multidisciplinaire. Vous préparerez un projet de recherche permettant de rejoindre l’une des équipes de l’un des laboratoires cibles.

Profil du candidat :
Le profil est large, avec un fléchage soit vers le laboratoire GRETSIA, soit vers le laboratoire LIGM. Pour une intégration au sein de l’équipe A3SI du LIGM, un profil de recherche en image et/ou data serait apprécié.

Si vous êtes intéressé par une intégration au sein de l’équipe A3SI, n’hésitez pas à contacter Laurent Najman (laurent.najman@esiee.fr) dès maintenant afin d’échanger et de préparer votre projet.

Formation et compétences requises :
Doctorat

Expérience en analyse de donnée. Une expérience de recherche en image est un plus.

Adresse d’emploi :
ESIEE Paris – Université Gustave Eiffel
Cité Descartes, 2 Bd Blaise Pascal, 93160 Noisy-le-Grand

Document attaché : 202303100819_poste-a-pourvoir-enseignant-chercheur-donnees-applications.pdf

Advanced computational analysis for behavioral and neurophysiological recordings

Annonce en lien avec l’Action/le Réseau :

Thème :

Computational neuroscience

Présentation :

The recent years have seen the explosion of high-throughput neural recording methods: hundreds of individual neurons can now be monitored simultaneously using large-scale functional imaging or multisite electrode arrays. A comparable trend is observed in behavioral studies where new imaging technology produces high-resolution imaging of complex behaviors.
In order to extract meaningful information from these high-dimensional datasets, neurobiologists need to develop and use robust computational methods. This Summer school aims at addressing this need by offering theoretical as well as direct practical exposure to computational tools used in modern neuroscience to interpret high dimensional neurophysiological and behavioral signals associated to complex behaviors.

Du : 2023-08-06

Au : 2023-08-12

Lieu : Observatoire Océanologique de Banyuls-sur-Mer

Site Web : http://ibio.sorbonne-universite.fr/seminars-summer-schools/

Question Answering With Open Knowledge Bases

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : DOING/– — –

Laboratoire/Entreprise : SAMOVAR – Télécom SudParis
Durée : 6 mois
Contact : julien.romero@telecom-sudparis.eu
Date limite de publication : 2023-04-30

Contexte :
Given a text, it is possible to extract from it knowledge in the form of subject-predicate-object triples, where all components of the triples can be found in the text. This is called Open Information Extraction (OpenIE). For example, from the sentence “The fish swims happily in the ocean”, we can extract the triple (fish, swims, in the ocean). By gathering many of these statements, we obtain an Open Knowledge Base (OpenKB), with no constraints on the subjects, the predicates, and the objects.

Then, this OpenKB could be used for question answering (QA). There have been many approaches that target QA over non-open KBs. These approaches vary from crafting query templates that, once filled in, will be used to query the KB, to neural models, where the goal is to represent the question and the possible answers as latent vectors, where the correct answer should be close in the embedding space to the question. In this project, we will focus on neural models, particularly knowledge graph embeddings, i.e., continuous representations for the entities and relations that can generally capture relevant information about the graph’s structure.

The current way KB embeddings are computed raises two main challenges:
* Each entity and relation must be seen enough times during training so the system can learn relevant embeddings. The training is done taking edges information into account, so the entity or relation must be part of a sufficiently large number of edges.
* The textual representation of the verbal and noun phrases of the relations, subjects, and objects should be considered.

For example, a recent approach, MHGRN, computes embeddings by using a modified graph neural network architecture. This architecture, however, does not take into account the textual representation of relations.
A better approach is CARE, that relies on two main ideas. First, it clusters the subjects and objects and creates an unlabelled edge between entities in the same cluster. That partially reduces the problem of the entities connected to a small number of edges, by leveraging the connection with better connected entities. Then, it computes embeddings for the relations using GLOVE (word embeddings) and GRUs (recurrent neural networks). We believe that the approach in CARE could be improved by considering more modern neural architectures using message-passing algorithms and integrating the textual representation of predicates, objects, and subjects. In addition, we will investigate if the clustering step is necessary, as it can bring a bias for one important downstream application of KB embeddings: canonicalization, the task of finding a representative for a set of nodes or edges.

In this project, we will improve open KB embedding methods by:
* Exploring state-of-the-art neural architectures and language models.
* Integrating textual representations of the subject, predicate, and object.
* Investigating if clustering before embedding computation is necessary.
* Integrating embeddings into question-answering models.

Sujet :
The intern will start with a study of the state-of-the-art methods for OpenIE. First, they will get familiar with the traditional datasets and the primary baselines. Then, they will implement our new models and compare them with the previous works.

Profil du candidat :
The intern should be involved in a master’s program and have a good knowledge of machine learning, deep learning, natural language processing, and graphs. A good understanding of Python and the standard libraries used in data science (scikit-learn, PyTorch, pandas, transformers) is also expected. In addition, a previous experience with graph neural networks would be appreciated.

Formation et compétences requises :
The intern should be involved in a master’s program and have a good knowledge of machine learning, deep learning, natural language processing, and graphs. A good understanding of Python and the standard libraries used in data science (scikit-learn, PyTorch, pandas, transformers) is also expected. In addition, a previous experience with graph neural networks would be appreciated.

Adresse d’emploi :
The internship will take place at Telecom SudParis at Palaiseau and will be a collaboration with INRIA Saclay. The intern will join the computer science department. The internship is paid and will last six months.

If you are interested, please send us your resume, a transcript of your grades, and a cover letter (in French or English).

Document attaché : 202303081615_internship_openie.pdf

Job Recommendation From A Heterogeneous Graph

Offre en lien avec l’Action/le Réseau : DOING/– — –

Laboratoire/Entreprise : SAMOVAR – Télécom SudParis
Durée : 6 mois
Contact : julien.romero@telecom-sudparis.eu
Date limite de publication : 2023-04-30

Contexte :
Job recommendation is the task of associating candidates with jobs. This can be useful for candidates who would like to find to best possible jobs, for companies that want to find the rarest talents in the vast pool of candidates, but also for independent recruiters who need to be as precise as possible when they send a resume to a company.

In this internship, you will work on a new dataset for job recommendations. Its particularity is that it contains much additional information about candidates and jobs we can represent as a graph. Besides, it is very sensitive to the cold start problem: We have many new candidates and new jobs, and it restricts a lot of the algorithms we can use.

If we consider video recommendations on Youtube, an average viewer watches many videos, and each video is viewed many times. Therefore, when recommending new videos to a specific user, we can look at what other similar viewers watched and recommend the most relevant video. This is the principle of collaborative filtering. In our case, our users are likely to get a job and never come back. Likewise, jobs are associated with one person, and then, we are done with it. Therefore, we need to exploit extra information to make the recommendation.

For our dataset, we can represent our pool of candidates and jobs with a heterogeneous graph, connecting candidates and jobs, but also additional node types like skills, cities, or employment types. Because we have this expressive representation, we must adapt the existing algorithms. During the internship, we will see how graph neural networks can be used to make recommendations, and we will propose a new architecture to solve our specific problem.

The goal of this internship will be to publish a paper at an international conference. The intern will work together with a Ph.D. student.

Sujet :
The intern will start with a study of the state-of-the-art methods for recommendation centered on graphs. First, they will get familiar with the traditional datasets and the primary baselines. Then, they will implement our new models and compare them with the previous works.

Profil du candidat :
The intern should be involved in a master’s program and have a good knowledge of machine learning, deep learning, natural language processing, and graphs. A good understanding of Python and the standard libraries used in data science (scikit-learn, PyTorch, pandas, transformers) is also expected. In addition, a previous experience with graph neural networks would be appreciated.

Formation et compétences requises :
The intern should be involved in a master’s program and have a good knowledge of machine learning, deep learning, natural language processing, and graphs. A good understanding of Python and the standard libraries used in data science (scikit-learn, PyTorch, pandas, transformers) is also expected. In addition, a previous experience with graph neural networks would be appreciated.

Adresse d’emploi :
The internship will take place at Telecom SudParis at Palaiseau. The intern will join the computer science department. The internship is paid and will last six months.

If you are interested, please send us your resume, a transcript of your grades, and a cover letter (in French or English).

Document attaché : 202303081609_internship_job_recommandation.pdf