Offre en lien avec l’Action/le Réseau : – — –/– — –
Laboratoire/Entreprise : ERIC
Durée : 6 mois
Contact : jairo.cugliari@univ-lyon2.fr
Date limite de publication : 2020-12-31
Contexte :
En France, l’étude menée en 2016 par Santé Publique France a estimé à 48 000 le nombre de décès prématurés attribuables à la pollution de l’air (Pascal, 2016). Le Centre International de Recherche sur le Cancer (CIRC) a classé la pollution de l’air extérieur dans son ensemble et les particules fines en particulier, comme cancérogènes pour l’homme, avec des indications suffisantes pour un lien avec le cancer du poumon et des associations positives avec le cancer de la vessie (IARC Working Group on the Evaluation of Carcinogenic Risks to Humans, 2012).
C’est dans ce contexte que travaille depuis des années le Département Prévention Cancer Environnement du Centre Léon Bérard avec différents partenaires (e.g. Laboratoire de Mécanique des Fluides et d’Acoustique (UMR CNRS 5509 LMFA – École Centrale), Laboratoire Environnement Ville Société (UMR CNRS 5600 EVS – Lyon2/Lyon3) ou encore le Laboratoire d’Informatique (UMR CNRS 5205 LIRIS – Lyon2), l’INERIS ou encore Santé
Publique France) sur des études épidémiologiques sur les facteurs de risques environnementaux liés à différents cancers hormonaux (e.g. sein, testicule, etc.).
À titre d’illustration, pour le cancer du sein, le plus fréquent chez la femme, les causes environnementales et notamment l’exposition chronique à la pollution de l’air sont suspectées d’avoir un impact sur son incidence. En effet le dépistage, le vieillissement de la population et les facteurs de risque liés au mode de vie (alcool, alimentation, etc.) ne permettent pas d’expliquer à eux seuls les variations géographiques des taux d’incidence, et incitent, dès lors, à investiguer ces causes environnementales.
Dans le cadre d’une étude sur le risque de cancer du sien associée à l’exposition à la pollution de l’air, une simulation des concentrations de 8 polluants atmosphérique sur le territoire français a été réalisée via le modèle CHIMERE (modèle chimie-transport développé par l’INERIS). Nous disposons donc des concentrations horaires pour 8 polluants pour une
résolution fine (0,0625° x 0,125° soit environ 8 x 8 km) sur 21 ans 1990-2010.
Ce jeu de données permet d’analyser les expositions individuelles tout au long de la période pour les sujets d’études. La précision temporelle et la couverture spatiale permettent l’étude individuelle sur la période d’étude en suivant les parcours de vie : succession des lieux de résidence et des lieux de travail mais aussi les mobilités quotidiennes et prochainement
l’ensemble des autres activités quotidiennes (loisirs, visites, etc.) ainsi que des mobilités induites.
Néanmoins, ces données demeurent pour l’instant sous-exploitées notamment quant aux modèles spatio-temporels intrinsèques particulièrement aux niveaux les plus fins.
Dans ce contexte, le stage a pour objectif de contribuer, au sein d’un partenariat inédit entre le Centre Léon Bérard et le laboratoire ERIC, spécialisé en exploration de données temporelles, d’appréhender les modèles temporels et spatiaux sous-jacents permettant la synthèse et dès
lors l’exploitation routinière de ces données massives dans le cadre des présents et futurs projets épidémiologiques.
Sujet :
Vous serez chargé de la mise en place d’une méthodologie pour explorer des données spatio-temporelles complexes dans le but de proposer une/des synthèse·s de ces données singulières ou plurielles. Les données présentent plusieurs caractéristiques d’intérêt, ce sont de données multivariées avec une structure spatio-temporelle et la présence de phénomènes extrêmes. Il est envisagé que la personne recrutée exploite le plus grand nombre de ces caractéristiques dans les analyses. Une liste non exhaustive de missions du stage suit :
• Exploration statique des données horaires infra- et inter-polluant pour la détermination de profils types de pollution
• Analyse spatiale des polluants afin de déterminer les profils d’interactions
• Modélisation de la structure spatio-temporelle (par exemple en utilisant modèles additifs ou de données fonctionnelles)
• Caractériser les épisodes de concentration liés aux interactions de plusieurs polluants
Profil du candidat :
* Rigueur scientifique, capacité d’innovation et de synthèse.
* Capacité à lire et comprendre la littérature internationale (maîtrise de l’anglais scientifique)
* Maîtrise d’au moins un logiciel d’analyse de données (R, Python)
* Autonomie, bonnes qualités relationnelles et capacité à travailler en équipe
pluridisciplinaire
Formation et compétences requises :
Étudiant·e de M2 à orientation data science
Adresse d’emploi :
Laboratoire ERIC | Université Lumière Lyon 2 (5 avenue Pierre Mendès France, 69676 Bron, https://eric.msh-lse.fr/)
Merci d’adresser, votre candidature avec un CV, une lettre de motivation ainsi que vos notes de l’année universitaire en cours et de l’année dernière à Leny.Grassot@lyon.unicancer.fr, Thomas.Coudon@lyon.unicancer.fr et Jairo.Cugliari@univ-lyon2.fr.
Document attaché : 202011261447_OffreStageM2_CLB-ERIC_2021.pdf