Observation et caractérisation des déformations 3D d’organes à tissus mous par IRM ultra rapide

When:
30/06/2019 – 01/07/2019 all-day
2019-06-30T02:00:00+02:00
2019-07-01T02:00:00+02:00

Annonce en lien avec l’Action/le Réseau : aucun

Laboratoire/Entreprise : Laboratoire d’Informatique et Systèmes, LIS – UMR CNRS 7020
Durée : 12-16 mois
Contact : marc-emmanuel.bellemare@univ-amu.fr
Date limite de publication : 2019-06-30

Contexte :
Le travail se déroulera à Marseille essentiellement au laboratoire d’informatique et des systèmes (LIS) dans l’équipe Image & Modèles. Le LIS UMR 7020 fédère plus de 375 membres ; 190 permanents chercheurs et enseignants chercheurs, plus de 125 doctorants, plus de 40 post-doctorants et 20 IT/IATSS. La recherche y est structurée au sein de pôles (calcul, science des données, analyse et contrôle des systèmes, signal et image), et centrée sur les activités fondamentales et appliquées dans les domaines de l’informatique, de l’automatique, du signal et de l’image. Le (ou la) candidat.e sera également amené.e à se rendre sur le site de l’hôpital de la Timone pour contribuer au développement des séquences IRM au CRMBM ainsi que pour des échanges avec les partenaires cliniciens. Le CRMBM UMR 7339 est le centre marseillais spécialiste de l’IRM regroupant 80 chercheurs et adossé au CEMEREM qui est la plateforme des imageurs à 1,5T, 3T et 7T entre autres.

Sujet :
Les troubles de la statique pelvienne regroupent un ensemble de pathologies qui induisent une altération dramatique de la qualité de vie des malades. La physiopathologie de ces troubles reste encore mal connue ce qui complique leur prise en charge. Nous proposons de contribuer à améliorer ces deux points en développant une séquence d’acquisition IRM associée à une reconstruction volumique adaptée à la visualisation du mouvement des organes en 3D. Le travail de recherche consistera à proposer une stratégie de modélisation des volumes des organes à partir de séquences IRM ultra rapides. La visualisation du mouvement et de la déformation de ces organes en 3D est nouvelle [ISBI 2019]. Par ailleurs, des outils de caractérisation des surfaces reconstruites seront proposés pour en permettre l’analyse et l’évaluation quantitative.

Profil du candidat :
Titulaire d’un doctorat dans un domaine connexe à la modélisation géométrique, la caractérisation de surfaces, la segmentation en 3D à partir d’IRM. Il ou elle sera intéressé.e par un projet pluridisciplinaire et par l’imagerie médicale.

Formation et compétences requises :
Des compétences en traitement d’images et en mathématiques appliquées seront particulièrement appréciées. Le langage python sera l’outil de développement privilégié.

Adresse d’emploi :
Laboratoire d’Informatique et Systèmes – LIS – UMR CNRS 7020 – Aix-Marseille Université
Campus scientifique de St Jérôme – Av. Escadrille Normandie Niemen -13397 Marseille Cedex 20

Document attaché : Postdoc_IRM3D_2019.pdf